More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1841 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1867  response regulator receiver protein  98.96 
 
 		 578 aa  1164    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1841  response regulator receiver protein  100 
 
 		 578 aa  1173    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0462  response regulator receiver protein  44.33 
 
 		 564 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0227  response regulator receiver protein  34.8 
 
 		 585 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0613  response regulator receiver protein  35.73 
 
 		 649 aa  311  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0315  response regulator receiver protein  35.39 
 
 		 582 aa  308  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0538  response regulator receiver domain-containing protein  36.1 
 
 		 588 aa  306  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1802  response regulator receiver domain-containing protein  29.17 
 
 		 540 aa  229  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0482194 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17441  hypothetical protein  29.37 
 
 		 558 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09661  hypothetical protein  28.67 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.308392  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0203  CheY-like domain-containing protein  25.92 
 
 		 531 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0793618  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08351  hypothetical protein  25.97 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0702953  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0779  hypothetical protein  28.36 
 
 		 540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.609123  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1874  hypothetical protein  33.16 
 
 		 539 aa  106  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0803  hypothetical protein  26.88 
 
 		 538 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.227323  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08591  hypothetical protein  26.92 
 
 		 538 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.26664  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08561  hypothetical protein  34.67 
 
 		 538 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07861  hypothetical protein  24.56 
 
 		 540 aa  97.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0763804  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 221 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 221 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 227 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.8 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 215 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.17 
 
 		 210 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.17 
 
 		 210 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0194  two component LuxR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 262 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00139406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.81 
 
 		 218 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 231 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 220 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  25.13 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.47 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  26.23 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_002936  DET1561  LuxR family DNA-binding response regulator  25.98 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0012725  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.59 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  21.57 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  25.74 
 
 		 214 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.66 
 
 		 226 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.19 
 
 		 226 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 214 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 212 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  28.23 
 
 		 212 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 207 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  27.01 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  25.23 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.1 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  28.69 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  28.69 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  28.69 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  27.05 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  22.28 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  24.46 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.33 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.46 
 
 		 1648 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2137  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.38 
 
 		 211 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.64 
 
 		 215 aa  60.1  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 215 aa  60.1  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  26.61 
 
 		 210 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 215 aa  59.3  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.39 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 237 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 216 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 226 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1358  two component LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4648  two component LuxR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.23 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0192  response regulator transcription regulator protein  26.61 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.028731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25402  predicted protein  31.3 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.013853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19270  predicted protein  31.3 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000929015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  19.7 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  24.59 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6866  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140006  normal  0.169631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.19 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1888  two component transcriptional regulator, LuxR family  24 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5845  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.91 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3068  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.44153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3794  two component LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0559  two component LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  57  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0841173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 210 aa  57  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.46 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1318  DNA-binding response regulator, LuxR family  22.22 
 
 		 222 aa  57  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.2 
 
 		 207 aa  57  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 215 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2153  two component LuxR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 213 aa  57  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.848776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>