More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0613 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0613  response regulator receiver protein  100 
 
 		 649 aa  1307    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0315  response regulator receiver protein  38.76 
 
 		 582 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0538  response regulator receiver domain-containing protein  38.35 
 
 		 588 aa  360  6e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0227  response regulator receiver protein  36.42 
 
 		 585 aa  356  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0462  response regulator receiver protein  34.12 
 
 		 564 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1841  response regulator receiver protein  35.57 
 
 		 578 aa  323  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1867  response regulator receiver protein  35.57 
 
 		 578 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1802  response regulator receiver domain-containing protein  30.31 
 
 		 540 aa  251  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0482194 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0779  hypothetical protein  30.53 
 
 		 540 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.609123  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17441  hypothetical protein  27.03 
 
 		 558 aa  137  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1874  hypothetical protein  36.28 
 
 		 539 aa  131  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09661  hypothetical protein  27.35 
 
 		 551 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.308392  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0203  CheY-like domain-containing protein  26.75 
 
 		 531 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0793618  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08351  hypothetical protein  26.75 
 
 		 531 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0702953  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08591  hypothetical protein  26.72 
 
 		 538 aa  101  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.26664  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08561  hypothetical protein  26.17 
 
 		 538 aa  98.2  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07861  hypothetical protein  27.29 
 
 		 540 aa  92.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0763804  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0803  hypothetical protein  26.61 
 
 		 538 aa  91.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.227323  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  83.2  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.34 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.34 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.89 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.58 
 
 		 236 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  28.17 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 254 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 242 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0293  two component LuxR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.71 
 
 		 222 aa  63.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.66 
 
 		 216 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  27.15 
 
 		 227 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.36 
 
 		 241 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.37 
 
 		 233 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.24 
 
 		 247 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.94 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.87 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  27.01 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  27.01 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3743  two component LuxR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19270  predicted protein  28.07 
 
 		 275 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000929015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 220 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 224 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25402  predicted protein  28.07 
 
 		 278 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.013853 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.01 
 
 		 217 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.02 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.59 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  28.89 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.06 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.32 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  26.62 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1561  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 199 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 217 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  26.01 
 
 		 206 aa  56.6  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 214 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4942  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.97 
 
 		 222 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4035  two component LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 228 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1676  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.88 
 
 		 228 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0710  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 240 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 303 aa  57  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  24 
 
 		 216 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 208 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3764  response regulator receiver  24.44 
 
 		 217 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321181  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.41 
 
 		 253 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1144  DNA-binding response regulator  30.29 
 
 		 247 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 257 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3789  response regulator receiver  29.25 
 
 		 228 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.15 
 
 		 226 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  25.79 
 
 		 206 aa  55.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3409  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.24 
 
 		 221 aa  55.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306896  hitchhiker  0.000114505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 237 aa  55.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  22.65 
 
 		 213 aa  54.7  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0043  two component LuxR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 234 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  22.65 
 
 		 213 aa  54.7  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  31.11 
 
 		 213 aa  54.3  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  26.53 
 
 		 214 aa  54.3  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 232 aa  54.3  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 222 aa  53.9  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.06 
 
 		 352 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0445779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 213 aa  53.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  25.11 
 
 		 216 aa  53.5  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 216 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  29.41 
 
 		 242 aa  53.5  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 219 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.22 
 
 		 220 aa  53.5  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 221 aa  53.5  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 213 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 237 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2401  response regulator receiver  23.97 
 
 		 230 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 228 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0986  LuxR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 217 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>