More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0538 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0538  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 588 aa  1174    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0315  response regulator receiver protein  58.95 
 
 		 582 aa  654    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0613  response regulator receiver protein  38.35 
 
 		 649 aa  365  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0227  response regulator receiver protein  41.48 
 
 		 585 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0462  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 564 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1841  response regulator receiver protein  35.69 
 
 		 578 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1867  response regulator receiver protein  35.69 
 
 		 578 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1802  response regulator receiver domain-containing protein  32.99 
 
 		 540 aa  263  6e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0482194 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0779  hypothetical protein  28.4 
 
 		 540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.609123  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17441  hypothetical protein  27.29 
 
 		 558 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0203  CheY-like domain-containing protein  23.79 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0793618  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09661  hypothetical protein  34.08 
 
 		 551 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.308392  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1874  hypothetical protein  30.36 
 
 		 539 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08351  hypothetical protein  23.56 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0702953  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 223 aa  94.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 227 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0803  hypothetical protein  30.11 
 
 		 538 aa  88.2  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.227323  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08561  hypothetical protein  30.11 
 
 		 538 aa  87.8  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08591  hypothetical protein  30.11 
 
 		 538 aa  87.8  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.26664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 212 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07861  hypothetical protein  30.64 
 
 		 540 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0763804  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.57 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.57 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 214 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 214 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.53 
 
 		 352 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0445779 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.5 
 
 		 220 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.17 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  31.69 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  33.57 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4942  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 222 aa  69.3  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  32.35 
 
 		 218 aa  68.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  31.16 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1121  two component LuxR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.864132  normal  0.872256 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  30.32 
 
 		 215 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  30.32 
 
 		 215 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  30.32 
 
 		 215 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  29.68 
 
 		 215 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  30.32 
 
 		 215 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.91 
 
 		 214 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  30.32 
 
 		 215 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  30.32 
 
 		 215 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 221 aa  66.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  30.32 
 
 		 215 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 214 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.43 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 227 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3743  two component LuxR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3523  two component LuxR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.57 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  30.66 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2295  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.74 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.61 
 
 		 210 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.07 
 
 		 222 aa  63.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  31.11 
 
 		 221 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 214 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  33.11 
 
 		 213 aa  63.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.65 
 
 		 218 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  32.24 
 
 		 213 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.61 
 
 		 210 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  28.66 
 
 		 206 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  33.81 
 
 		 231 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  30.08 
 
 		 223 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  30.97 
 
 		 216 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  30.67 
 
 		 219 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1864  two component LuxR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 205 aa  62  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.09 
 
 		 216 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5199  two component LuxR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 225 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.33 
 
 		 214 aa  62  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0083  two component LuxR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 210 aa  62  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  29.85 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.85 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.33 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1561  LuxR family DNA-binding response regulator  26.62 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0012725  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.76 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1571  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.58 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.36 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.74 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 219 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1318  DNA-binding response regulator, LuxR family  26.67 
 
 		 222 aa  60.1  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25402  predicted protein  32.48 
 
 		 278 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.013853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.85 
 
 		 216 aa  60.1  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>