More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0462 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0462  response regulator receiver protein  100 
 
 		 564 aa  1118    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1867  response regulator receiver protein  44.15 
 
 		 578 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1841  response regulator receiver protein  44.33 
 
 		 578 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0227  response regulator receiver protein  36.05 
 
 		 585 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0538  response regulator receiver domain-containing protein  37.14 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0315  response regulator receiver protein  36.66 
 
 		 582 aa  300  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0613  response regulator receiver protein  34.28 
 
 		 649 aa  291  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1802  response regulator receiver domain-containing protein  29.97 
 
 		 540 aa  216  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0482194 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17441  hypothetical protein  27.85 
 
 		 558 aa  136  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0779  hypothetical protein  28.5 
 
 		 540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.609123  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0203  CheY-like domain-containing protein  26.56 
 
 		 531 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0793618  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1874  hypothetical protein  33.68 
 
 		 539 aa  121  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09661  hypothetical protein  34.8 
 
 		 551 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.308392  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08351  hypothetical protein  26.32 
 
 		 531 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0702953  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08561  hypothetical protein  31.48 
 
 		 538 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07861  hypothetical protein  25 
 
 		 540 aa  83.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0763804  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08591  hypothetical protein  32.05 
 
 		 538 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.26664  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0803  hypothetical protein  31.48 
 
 		 538 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.227323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3024  DNA-binding response regulator GacA  33.33 
 
 		 214 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1561  LuxR family DNA-binding response regulator  29.6 
 
 		 226 aa  72.8  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0012725  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 223 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25030  Response regulator GacA  31.45 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2897  LuxR response regulator receiver  34.15 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.017691  normal  0.317002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  33.33 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  33.33 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.28 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4099  DNA-binding response regulator GacA  33.33 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1765  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456405  hitchhiker  0.00257365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3672  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  hitchhiker  0.000000290511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 227 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1318  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.54 
 
 		 222 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1895  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.08 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  28.57 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2375  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.405291  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  31.5 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  27.43 
 
 		 235 aa  67  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 236 aa  67  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  32.5 
 
 		 242 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.04 
 
 		 213 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 236 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  32.77 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  29.03 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5845  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.74 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  27.13 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  27.13 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  28.33 
 
 		 214 aa  63.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 		 215 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0295  two component LuxR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 243 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2054  response regulator receiver domain-containing protein  29.75 
 
 		 198 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 212 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  29.66 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.6 
 
 		 210 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 		 247 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3067  two component LuxR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.66 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 214 aa  62  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1556  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.97 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0677  two component LuxR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.61 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.59 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0703  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000151408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2061  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.61 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 219 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  28.91 
 
 		 214 aa  60.1  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.45 
 
 		 201 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.98 
 
 		 217 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  25.84 
 
 		 234 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 215 aa  60.1  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 213 aa  60.1  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_91  DNA-binding response regulator, LuxR family  28.12 
 
 		 243 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.41 
 
 		 223 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0651  two component LuxR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 209 aa  59.7  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.01 
 
 		 220 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  29.66 
 
 		 213 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 		 218 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.33 
 
 		 215 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  26.67 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03380  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.03 
 
 		 153 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>