More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3251 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
319 aa  669    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  79.3 
 
 
323 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  79.3 
 
 
323 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1105  NAD-dependent epimerase/dehydratase  75.32 
 
 
331 aa  517  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2945  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.2 
 
 
329 aa  509  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.61 
 
 
318 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.4 
 
 
320 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.13 
 
 
336 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.977894  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.56 
 
 
317 aa  432  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1552  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.92 
 
 
324 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.717639 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.87 
 
 
334 aa  339  4e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  46.94 
 
 
373 aa  309  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.54 
 
 
320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.4 
 
 
330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.18 
 
 
344 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.79 
 
 
360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.18 
 
 
361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.51 
 
 
359 aa  303  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.45 
 
 
362 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.03 
 
 
362 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.96 
 
 
324 aa  298  8e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.44 
 
 
324 aa  297  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.72 
 
 
362 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.76 
 
 
321 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1005  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.02 
 
 
348 aa  295  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.02 
 
 
328 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.18 
 
 
327 aa  295  9e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.77 
 
 
329 aa  295  9e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.02 
 
 
351 aa  295  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  46.3 
 
 
348 aa  294  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.3 
 
 
348 aa  294  1e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4754  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.45 
 
 
350 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.14 
 
 
345 aa  293  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.86 
 
 
327 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.18 
 
 
327 aa  293  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.28 
 
 
344 aa  292  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.73 
 
 
338 aa  292  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.69 
 
 
380 aa  292  5e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.68 
 
 
343 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.68 
 
 
343 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45 
 
 
368 aa  291  7e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.45 
 
 
351 aa  291  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0963  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.45 
 
 
351 aa  291  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.6787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.15 
 
 
325 aa  291  8e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.86 
 
 
358 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.82 
 
 
368 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 
346 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  44.38 
 
 
355 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.65 
 
 
345 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 
346 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0368373 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0492  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.32 
 
 
344 aa  290  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0759  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.02 
 
 
346 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.54 
 
 
353 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4012  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.31 
 
 
357 aa  289  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.52 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.98 
 
 
322 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.68 
 
 
342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1701  GDP-mannose 4,6 dehydratase  44.41 
 
 
346 aa  288  6e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.286403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1630  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 
346 aa  288  6e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333823  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0690  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.71 
 
 
347 aa  289  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00490394  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1158  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.55 
 
 
344 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00134514  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2872  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.68 
 
 
340 aa  288  9e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.1 
 
 
362 aa  287  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4203  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.45 
 
 
340 aa  287  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.62 
 
 
347 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.390497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1429  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.99 
 
 
369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4612  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.88 
 
 
347 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714119  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3362  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.23 
 
 
388 aa  286  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 
346 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.61 
 
 
345 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.51 
 
 
342 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.47 
 
 
344 aa  285  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1146  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.93 
 
 
372 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.93 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 
346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.67 
 
 
361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6734  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.16 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.83 
 
 
348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5682  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.13 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3358  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591242  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0425  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.8 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 
348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879039  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3559  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.71 
 
 
348 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0335248  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1965  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.32 
 
 
347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.71 
 
 
348 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3970  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.71 
 
 
348 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122884  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1660  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.11 
 
 
347 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1709  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.11 
 
 
347 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0269381  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2295  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.11 
 
 
347 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0502351  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2234  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.32 
 
 
347 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.666066  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0540  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.11 
 
 
347 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1868  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.11 
 
 
347 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2434  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.11 
 
 
347 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186201  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2115  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 
348 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.12 
 
 
331 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0758  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.81 
 
 
347 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627474  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2901  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.35 
 
 
361 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0330  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.52 
 
 
370 aa  281  8.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.125638  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.54 
 
 
368 aa  281  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.21 
 
 
367 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>