More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2945 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2945  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 329 aa  680    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.2 
 
 		 319 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.38 
 
 		 323 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.38 
 
 		 323 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1105  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.12 
 
 		 331 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.67 
 
 		 318 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.51 
 
 		 320 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.86 
 
 		 336 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.977894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.72 
 
 		 317 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1552  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.61 
 
 		 324 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.717639 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.33 
 
 		 334 aa  321  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.47 
 
 		 330 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.28 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.4 
 
 		 325 aa  311  7.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.87 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.55 
 
 		 324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.68 
 
 		 359 aa  307  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.48 
 
 		 322 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.5 
 
 		 327 aa  305  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.59 
 
 		 358 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.63 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.31 
 
 		 380 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.2 
 
 		 320 aa  301  8.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.88 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.52 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1090  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.03 
 
 		 370 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5153  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.35 
 
 		 370 aa  299  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000400711  normal  0.218522 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3358  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.83 
 
 		 348 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.83 
 
 		 348 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.26 
 
 		 362 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.01 
 
 		 368 aa  298  9e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.47 
 
 		 362 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  45.83 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0690  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.92 
 
 		 347 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00490394  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.26 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2234  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.32 
 
 		 347 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.666066  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.04 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.35 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.67 
 
 		 342 aa  296  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.44 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1965  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.32 
 
 		 347 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.9 
 
 		 343 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4203  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.32 
 
 		 340 aa  295  7e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.43 
 
 		 367 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  45.9 
 
 		 355 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3559  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.53 
 
 		 348 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0335248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.3 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  44.92 
 
 		 340 aa  294  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.53 
 
 		 348 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3970  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.53 
 
 		 348 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.46 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.29 
 
 		 343 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.64 
 
 		 363 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4612  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.92 
 
 		 347 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4012  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.06 
 
 		 357 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2115  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.22 
 
 		 348 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.71 
 
 		 346 aa  292  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0759  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.71 
 
 		 346 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.65 
 
 		 327 aa  292  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.42 
 
 		 348 aa  291  8e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2295  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.62 
 
 		 347 aa  291  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0502351  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  46.42 
 
 		 348 aa  291  8e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0425  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.94 
 
 		 353 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0540  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.62 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1709  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.62 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0269381  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0758  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.62 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627474  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.81 
 
 		 353 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1660  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.62 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2434  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.62 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186201  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1868  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.62 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0330  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.13 
 
 		 370 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.125638  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.62 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3411  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.25 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.58 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5682  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.73 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.79 
 
 		 345 aa  289  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0492  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 		 344 aa  289  4e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.07 
 
 		 338 aa  289  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2592  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.57 
 
 		 339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3292  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.57 
 
 		 343 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.694312  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2977  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.57 
 
 		 339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.78 
 
 		 347 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.390497 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2890  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.57 
 
 		 343 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.657822  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.18 
 
 		 368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 		 346 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1158  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.58 
 
 		 344 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00134514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.92 
 
 		 327 aa  288  8e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000104251 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.18 
 
 		 344 aa  288  9e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1923  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.7 
 
 		 359 aa  287  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.578659  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.11 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71990  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.08 
 
 		 323 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.07 
 
 		 345 aa  286  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2129  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.98 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02910  GDP-D-mannose dehydratase  43.48 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.25 
 
 		 348 aa  287  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0400  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.88 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0059  GDP-D-mannose dehydratase  43.48 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0880  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.88 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3362  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.66 
 
 		 388 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4001  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.16 
 
 		 378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>