More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2591 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 320 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.7 
 
 		 318 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.4 
 
 		 319 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1105  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.14 
 
 		 331 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2945  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.51 
 
 		 329 aa  462  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.95 
 
 		 323 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.95 
 
 		 323 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.92 
 
 		 336 aa  426  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.977894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.33 
 
 		 317 aa  418  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1552  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.96 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.717639 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.6 
 
 		 334 aa  332  4e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.31 
 
 		 362 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48 
 
 		 360 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48 
 
 		 362 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.31 
 
 		 342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4754  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.07 
 
 		 350 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.94 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.15 
 
 		 359 aa  308  9e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  45.45 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0400  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.51 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0880  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.51 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.95 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4012  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.24 
 
 		 357 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.47 
 
 		 331 aa  299  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.2 
 
 		 351 aa  299  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.34 
 
 		 328 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.69 
 
 		 327 aa  298  9e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.29 
 
 		 328 aa  297  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.66 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0059  GDP-D-mannose dehydratase  43.39 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.9 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0963  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.66 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.6787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.35 
 
 		 346 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.52 
 
 		 323 aa  296  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.21 
 
 		 344 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0759  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.35 
 
 		 346 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4203  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.04 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3411  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.11 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.13 
 
 		 329 aa  296  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0330  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.71 
 
 		 370 aa  295  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.125638  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.02 
 
 		 343 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.06 
 
 		 368 aa  295  8e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1090  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.73 
 
 		 370 aa  295  8e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.84 
 
 		 327 aa  295  8e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.13 
 
 		 348 aa  295  9e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  46.13 
 
 		 348 aa  295  9e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.03 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.14 
 
 		 346 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4001  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.58 
 
 		 378 aa  293  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.32 
 
 		 343 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  45.02 
 
 		 355 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.53 
 
 		 338 aa  292  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.13 
 
 		 327 aa  292  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5153  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.21 
 
 		 370 aa  292  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000400711  normal  0.218522 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02910  GDP-D-mannose dehydratase  43.55 
 
 		 372 aa  291  7e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.54 
 
 		 325 aa  291  9e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1701  GDP-mannose 4,6 dehydratase  45.35 
 
 		 346 aa  291  9e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.286403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1630  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.35 
 
 		 346 aa  291  9e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333823  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.79 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.56 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  46.25 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.39 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6734  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.01 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.56 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.35 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4139  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.71 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.927486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1158  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.01 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00134514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2614  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.73 
 
 		 342 aa  290  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.71 
 
 		 363 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.2 
 
 		 349 aa  289  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.88 
 
 		 345 aa  289  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3954  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44 
 
 		 370 aa  289  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47 
 
 		 368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2234  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.22 
 
 		 347 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.666066  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3362  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.19 
 
 		 388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.06 
 
 		 367 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.48 
 
 		 362 aa  288  7e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1762  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.02 
 
 		 349 aa  288  7e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.08 
 
 		 323 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1965  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.22 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0522  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.44 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.68 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.04 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2471  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.95 
 
 		 375 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236107  normal  0.502765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.43 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2129  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.65 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2901  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.66 
 
 		 361 aa  286  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.04 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1790  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.94 
 
 		 372 aa  286  2e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.4 
 
 		 361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.08 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.41 
 
 		 344 aa  286  4e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43847  predicted protein  45.16 
 
 		 362 aa  286  4e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.379971  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3358  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.05 
 
 		 348 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.05 
 
 		 348 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1249  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.97 
 
 		 355 aa  285  5e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.15 
 
 		 327 aa  286  5e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000104251 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 		 347 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.390497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0821  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.67 
 
 		 372 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>