More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2106 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 323 aa  672    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 323 aa  672    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  79.3 
 
 		 319 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2945  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.38 
 
 		 329 aa  493  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.25 
 
 		 318 aa  481  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1105  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.03 
 
 		 331 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.95 
 
 		 320 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.82 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.977894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.08 
 
 		 317 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1552  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.37 
 
 		 324 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.717639 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.74 
 
 		 334 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.48 
 
 		 362 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.48 
 
 		 362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.08 
 
 		 360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.34 
 
 		 359 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.96 
 
 		 324 aa  299  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.25 
 
 		 320 aa  299  5e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.84 
 
 		 330 aa  298  7e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.13 
 
 		 324 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.48 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.77 
 
 		 325 aa  293  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.12 
 
 		 342 aa  293  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.57 
 
 		 348 aa  292  6e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  45.57 
 
 		 348 aa  292  6e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.6 
 
 		 380 aa  291  8e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  46.31 
 
 		 373 aa  291  9e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.45 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.5 
 
 		 327 aa  289  3e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000104251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.77 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.94 
 
 		 322 aa  288  6e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.96 
 
 		 362 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.79 
 
 		 345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.72 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.06 
 
 		 329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.19 
 
 		 353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0759  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.61 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4203  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.92 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.73 
 
 		 346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3444  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.93 
 
 		 334 aa  282  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.45 
 
 		 368 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.4 
 
 		 368 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0368373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.45 
 
 		 368 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.37 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.66 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.61 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.69 
 
 		 327 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.51 
 
 		 343 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.71 
 
 		 338 aa  279  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1005  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.24 
 
 		 348 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403291  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.55 
 
 		 327 aa  278  8e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1146  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.1 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  45.2 
 
 		 340 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.24 
 
 		 332 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0229632  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2872  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.17 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.87 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4012  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.78 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4001  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.54 
 
 		 378 aa  275  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.65 
 
 		 348 aa  275  6e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.73 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.17 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.32 
 
 		 343 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.57 
 
 		 360 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1630  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.28 
 
 		 346 aa  275  9e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333823  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1701  GDP-mannose 4,6 dehydratase  44.28 
 
 		 346 aa  275  9e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.286403  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02910  GDP-D-mannose dehydratase  40.85 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.73 
 
 		 363 aa  274  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4754  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.65 
 
 		 350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.04 
 
 		 351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.66 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0963  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.04 
 
 		 351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.6787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  42.69 
 
 		 355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.11 
 
 		 347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.390497 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0690  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.27 
 
 		 347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00490394  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1429  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.48 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2097  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.66 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822363  hitchhiker  0.0000115306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.53 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.27 
 
 		 361 aa  272  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.82 
 
 		 351 aa  272  7e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0330  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.33 
 
 		 370 aa  271  9e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.125638  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1523  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.06 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2592  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.71 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2977  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.71 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2117  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  42.22 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.579852  normal  0.77541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.06 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2471  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.6 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236107  normal  0.502765 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1407  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.98 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000685892  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0540  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.98 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1709  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.98 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0269381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2434  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.98 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186201  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0758  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.98 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627474  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2890  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.71 
 
 		 343 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.657822  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2115  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.82 
 
 		 348 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.74 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2295  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.98 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0502351  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3292  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.71 
 
 		 343 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.694312  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.52 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1868  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.98 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350001  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1660  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.98 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>