More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2435 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 336 aa  693    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.977894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.82 
 
 		 323 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.82 
 
 		 323 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.44 
 
 		 318 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2945  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.86 
 
 		 329 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.13 
 
 		 319 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.92 
 
 		 320 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1105  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.74 
 
 		 331 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.62 
 
 		 317 aa  411  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1552  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.66 
 
 		 324 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.717639 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.88 
 
 		 334 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.71 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.58 
 
 		 360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.96 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.14 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.65 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.71 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.27 
 
 		 324 aa  279  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0759  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.35 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.15 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.390497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.59 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4754  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.69 
 
 		 350 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.57 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.77 
 
 		 359 aa  276  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.99 
 
 		 345 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6734  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.52 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.27 
 
 		 358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  43.41 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.06 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4203  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.49 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.04 
 
 		 346 aa  271  9e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.95 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.25 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1158  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.11 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00134514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.88 
 
 		 368 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.74 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2234  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.84 
 
 		 347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.666066  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.3 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.69 
 
 		 344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.89 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.3 
 
 		 343 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.82 
 
 		 344 aa  268  8e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.86 
 
 		 351 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0963  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.86 
 
 		 351 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.6787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1923  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.9 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.578659  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0419  GDP-mannose 4,6-dehydratase Bme9  44.08 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.39 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0362  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.79 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.94 
 
 		 329 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1005  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.44 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403291  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1965  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.54 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0690  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.34 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00490394  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1630  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.23 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333823  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2614  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.51 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.62 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0368373 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.68 
 
 		 325 aa  266  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1701  GDP-mannose 4,6 dehydratase  41.23 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.286403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.67 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.61 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.6 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2129  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.12 
 
 		 347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.7 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4612  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.34 
 
 		 347 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  40.97 
 
 		 373 aa  265  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0492  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.32 
 
 		 344 aa  265  8.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3372  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.79 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  40.79 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0540  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.34 
 
 		 347 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1709  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.34 
 
 		 347 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0269381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4012  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.06 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2434  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.34 
 
 		 347 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186201  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1660  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.34 
 
 		 347 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3358  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.94 
 
 		 348 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1868  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.34 
 
 		 347 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350001  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2471  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.78 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236107  normal  0.502765 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.61 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0330  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.52 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.125638  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.94 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0400  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.56 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0880  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.56 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1090  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.69 
 
 		 370 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.92 
 
 		 342 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.42 
 
 		 338 aa  263  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.82 
 
 		 344 aa  262  4.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.85 
 
 		 368 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.21 
 
 		 327 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.73 
 
 		 360 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2295  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.04 
 
 		 347 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0502351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.44 
 
 		 361 aa  262  6e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0758  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.04 
 
 		 347 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627474  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.99 
 
 		 345 aa  262  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.53 
 
 		 368 aa  261  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.48 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.35 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0425  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.58 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3444  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.72 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0059  GDP-D-mannose dehydratase  39.83 
 
 		 370 aa  261  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  41.74 
 
 		 348 aa  260  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2901  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.56 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>