More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0150 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 327 aa  687    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000104251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.63 
 
 		 323 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.29 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.4 
 
 		 368 aa  360  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00720  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.01 
 
 		 331 aa  361  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.240367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.11 
 
 		 324 aa  360  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.14 
 
 		 330 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1307  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.96 
 
 		 363 aa  355  5e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.111837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.77 
 
 		 322 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1053  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.96 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.53 
 
 		 324 aa  352  4e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.09 
 
 		 327 aa  349  4e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.35 
 
 		 368 aa  348  9e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.22 
 
 		 321 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.62 
 
 		 325 aa  345  5e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.65 
 
 		 345 aa  344  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5498  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.42 
 
 		 329 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.0182886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50 
 
 		 346 aa  339  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.08 
 
 		 328 aa  338  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4181  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.67 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.25 
 
 		 380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  48.66 
 
 		 355 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.66 
 
 		 343 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.44 
 
 		 345 aa  334  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.08 
 
 		 362 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.96 
 
 		 344 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.22 
 
 		 346 aa  332  4e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0400  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.76 
 
 		 372 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0880  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.76 
 
 		 372 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4012  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.16 
 
 		 357 aa  332  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.77 
 
 		 362 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5682  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.37 
 
 		 323 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.15 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.62 
 
 		 327 aa  329  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.06 
 
 		 327 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.7 
 
 		 340 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.23 
 
 		 342 aa  329  4e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.76 
 
 		 346 aa  328  8e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0368373 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3411  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.25 
 
 		 335 aa  328  8e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2115  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.06 
 
 		 348 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.8 
 
 		 345 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.63 
 
 		 323 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71990  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.63 
 
 		 323 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4287  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.54 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.47 
 
 		 348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0759  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.49 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3358  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.47 
 
 		 348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.4 
 
 		 344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3559  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.76 
 
 		 348 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0335248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.76 
 
 		 348 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3970  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.76 
 
 		 348 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0690  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.49 
 
 		 347 aa  325  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00490394  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4612  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.76 
 
 		 347 aa  325  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.38 
 
 		 328 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1158  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.9 
 
 		 344 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00134514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1701  GDP-mannose 4,6 dehydratase  48.51 
 
 		 346 aa  325  9e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.286403  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3292  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.99 
 
 		 343 aa  325  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.694312  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1630  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.51 
 
 		 346 aa  325  9e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333823  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2890  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.99 
 
 		 343 aa  325  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.657822  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2977  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.99 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2592  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.99 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4448  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.08 
 
 		 340 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.17 
 
 		 342 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1868  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.78 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350001  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0540  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.78 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1762  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.94 
 
 		 349 aa  323  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319433 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1709  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.78 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0269381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2434  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.78 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.77 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.9 
 
 		 346 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2295  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.78 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0502351  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1660  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.78 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6734  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.23 
 
 		 344 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0758  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.78 
 
 		 347 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627474  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.06 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.06 
 
 		 344 aa  322  4e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4754  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.07 
 
 		 350 aa  322  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2872  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.55 
 
 		 340 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.93 
 
 		 359 aa  322  5e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.54 
 
 		 338 aa  322  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0492  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.06 
 
 		 344 aa  322  5e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.59 
 
 		 343 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4424  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.08 
 
 		 340 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.92 
 
 		 329 aa  322  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.38 
 
 		 351 aa  321  9.000000000000001e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1407  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.13 
 
 		 384 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000685892  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.91 
 
 		 347 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.390497 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  48 
 
 		 373 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.85 
 
 		 328 aa  318  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.93 
 
 		 349 aa  318  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1523  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.11 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  48.6 
 
 		 340 aa  317  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2129  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.75 
 
 		 347 aa  316  4e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2622  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.4 
 
 		 344 aa  316  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207032  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.04 
 
 		 351 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0963  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.04 
 
 		 351 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.6787 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.56 
 
 		 363 aa  315  5e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.75 
 
 		 360 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.84 
 
 		 348 aa  315  6e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1005  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.2 
 
 		 348 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>