106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1861 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1861  nitroreductase  100 
 
 
294 aa  610  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  33.33 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  29.61 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  30.52 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  31.38 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  28.71 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  30.58 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.98 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.98 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  30.96 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.98 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  27.98 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  29.44 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  29.13 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  27.98 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  27.98 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  27.98 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  27.41 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  28.5 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  25.76 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  27.98 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  30.06 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  30.38 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  29.67 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  28.89 
 
 
246 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  26.7 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  26.7 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  29.03 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  27.64 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  29.77 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  30.1 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  26.8 
 
 
244 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  29.35 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  31.22 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  28.07 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  34.08 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  28.51 
 
 
240 aa  62.8  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  29.56 
 
 
285 aa  62.4  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  26.73 
 
 
239 aa  62.4  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  29.57 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  28.16 
 
 
251 aa  61.6  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  31.91 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  30.2 
 
 
239 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  29.66 
 
 
242 aa  60.1  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  30.89 
 
 
274 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.73 
 
 
186 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  28.16 
 
 
240 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  28.16 
 
 
240 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.154506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  27.78 
 
 
240 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  27.78 
 
 
240 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  27.78 
 
 
240 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  27.78 
 
 
240 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  28.16 
 
 
240 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  33.17 
 
 
273 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  27.09 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  30.47 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  27.92 
 
 
240 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.64 
 
 
186 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  25.22 
 
 
269 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  29.53 
 
 
316 aa  55.8  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  28.5 
 
 
240 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  28.5 
 
 
240 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  28.5 
 
 
240 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  28.5 
 
 
240 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  27.64 
 
 
240 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  27.78 
 
 
188 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  25.79 
 
 
199 aa  53.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  27.16 
 
 
274 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  28.02 
 
 
240 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.12 
 
 
194 aa  52.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  22.92 
 
 
202 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  28.06 
 
 
238 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.68 
 
 
202 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.01 
 
 
170 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.04 
 
 
186 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  29.13 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  27.27 
 
 
278 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  27.84 
 
 
200 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  31.33 
 
 
184 aa  49.3  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  24.85 
 
 
251 aa  48.9  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.68 
 
 
190 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  29.69 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  26.14 
 
 
176 aa  47.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  23.27 
 
 
200 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  26.95 
 
 
166 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  25.91 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  24.26 
 
 
213 aa  47.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  27.04 
 
 
186 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  23.36 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  24.62 
 
 
196 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  25.3 
 
 
166 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.67 
 
 
179 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.07 
 
 
183 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  26.09 
 
 
210 aa  44.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  21 
 
 
209 aa  43.9  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  24.37 
 
 
197 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  25.31 
 
 
175 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  30 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24.69 
 
 
165 aa  43.5  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  22.56 
 
 
188 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>