More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1424 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1424  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 280 aa  565  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.46169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3204  AraC family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 316 aa  209  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0220978  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  21.81 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  19.93 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  29.71 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.88 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  33.67 
 
 		 529 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  23.2 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 529 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  23.36 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  23.66 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  21.63 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23290  transcriptional regulator, AraC family  22.83 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  20 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  27.62 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  25.3 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  25.12 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  20.82 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  27.11 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  22.78 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18110  transcriptional regulator MmsR  24.21 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1573  transcriptional regulator MmsR  24.6 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  42.47 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  27.88 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0768  AraC family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3797  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00910315  normal  0.099485 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 538 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  22.62 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  25 
 
 		 537 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0415  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2354  transcriptional regulator, AraC family  27.68 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  19.2 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0347  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2506  transcriptional regulator, AraC family  26.88 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6978  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  44.19 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3619  transcriptional regulator, AraC family  32.52 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.425647 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.86 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4046  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0023  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5113  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.52445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4189  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0633  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274114  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.04 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03507  hypothetical protein  37.04 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.702446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  23.92 
 
 		 519 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  28.45 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0432  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 397 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  22.09 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0285  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000546061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 548 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 546 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 533 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  23.66 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2976  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00165868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  32.73 
 
 		 160 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1546  AraC family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000827637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  30.43 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 361 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 		 360 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03839  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.23 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  23.66 
 
 		 291 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4188  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5413  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 292 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  30.23 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 338 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4492  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.494011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>