More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3204 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3204  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  646    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0220978  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1424  AraC family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.46169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.97 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  25.1 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  24.53 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  35.8 
 
 		 529 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  35.8 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3070  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1546  AraC family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000827637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  20.65 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23290  transcriptional regulator, AraC family  21.05 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  23.88 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  23.31 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  24.79 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  23.42 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04223  HpaA  24.32 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04189  hypothetical protein  24.32 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3709  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.680131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4577  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  24.32 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1744  AraC family transcription regulator  24.1 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1655  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3816  transcriptional regulator, AraC family  24.52 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000942469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  19.71 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  33.33 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  23.64 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 548 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  25.87 
 
 		 270 aa  53.5  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  28 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  31.01 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 322 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7100  transcriptional regulator, AraC family  23.41 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723966  normal  0.268951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 317 aa  52.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 288 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  25.31 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  28.3 
 
 		 530 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  20.72 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  25.1 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1572  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  24.51 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  28.65 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  32.56 
 
 		 1376 aa  52  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3772  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  28.12 
 
 		 198 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  22.61 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2677  transcriptional regulator, AraC family  27.17 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  23.22 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  37.18 
 
 		 145 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  30.97 
 
 		 144 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  29.33 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2476  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2093  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 282 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 325 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2317  AraC family transcriptional regulator  23 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  31.68 
 
 		 255 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  22.52 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  22.83 
 
 		 287 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  22.83 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 255 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>