125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2157 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2157  2-methyleneglutarate mutase  100 
 
 		 616 aa  1269    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.937034  normal  0.527767 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1673  cobalamin B12-binding domain protein  33.57 
 
 		 153 aa  67.8  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 134 aa  67  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.04 
 
 		 140 aa  66.6  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0044288 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  30.08 
 
 		 138 aa  67  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0587  cobalamin B12-binding domain protein  31.62 
 
 		 135 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.901029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.34 
 
 		 133 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  31.82 
 
 		 138 aa  65.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  30.3 
 
 		 152 aa  65.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1910  cobalamin B12-binding domain protein  30.88 
 
 		 134 aa  65.1  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374857  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  35.07 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  28.03 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2998  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.651513  normal  0.0337584 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  33.83 
 
 		 141 aa  62.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3774  cobalamin B12-binding domain protein  33.58 
 
 		 157 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1487  cobalamin B12-binding domain protein  28.57 
 
 		 135 aa  62  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.40083  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  33.08 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  31.88 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2024  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.22 
 
 		 134 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000794891 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2805  cobalamin B12-binding domain protein  27.82 
 
 		 142 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.069341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0059  cobalamin B12-binding domain protein  31.58 
 
 		 136 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 134 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  27.21 
 
 		 139 aa  59.7  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1432  methylmalonyl-CoA mutase  26.62 
 
 		 140 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  31.58 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2055  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.08 
 
 		 155 aa  57.8  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.88 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7994  cobalamin B12-binding domain protein  29.71 
 
 		 135 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  31.34 
 
 		 134 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3814  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.16 
 
 		 134 aa  56.6  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6220  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4204  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.16 
 
 		 134 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3987  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 137 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  31.34 
 
 		 134 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.28 
 
 		 1106 aa  55.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  28.68 
 
 		 140 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4240  cobalamin B12-binding domain protein  28.79 
 
 		 139 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 137 aa  54.7  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0630027 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2098  cobalamin B12-binding domain protein  28.68 
 
 		 140 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  31.34 
 
 		 134 aa  55.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0318  cobalamin B12-binding domain protein  31.25 
 
 		 162 aa  55.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  29.71 
 
 		 128 aa  54.3  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.62 
 
 		 137 aa  54.3  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  27.94 
 
 		 140 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1242  methylmalonyl-CoA mutase  28.36 
 
 		 135 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778509 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  29.27 
 
 		 714 aa  52.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  29.84 
 
 		 740 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  37.84 
 
 		 210 aa  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.89 
 
 		 134 aa  52  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.89 
 
 		 1081 aa  51.2  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  40.91 
 
 		 213 aa  51.2  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  28.37 
 
 		 731 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  29.08 
 
 		 731 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  29.27 
 
 		 740 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  32.95 
 
 		 216 aa  51.2  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.81 
 
 		 134 aa  50.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.64 
 
 		 714 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  27.64 
 
 		 714 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  27.34 
 
 		 140 aa  50.4  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  27.64 
 
 		 714 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1023  methylaspartate mutase subunit S  27.91 
 
 		 139 aa  50.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0266173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6640  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.27 
 
 		 724 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.70273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0856  methylmalonyl-CoA mutase  34.07 
 
 		 714 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  27.64 
 
 		 714 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  27.64 
 
 		 714 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  27.64 
 
 		 714 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  27.64 
 
 		 714 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  26.81 
 
 		 715 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  29.13 
 
 		 716 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1347  methylaspartate mutase subunit S  26.47 
 
 		 137 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2692  cobalamin B12-binding domain protein  27.34 
 
 		 140 aa  49.7  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  37.04 
 
 		 733 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  29.5 
 
 		 712 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  26.83 
 
 		 714 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 208 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  28.57 
 
 		 139 aa  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1167  methylmalonyl-CoA mutase  27.94 
 
 		 712 aa  47.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169366  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  28.15 
 
 		 712 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1284  methylmalonyl-CoA mutase  27.64 
 
 		 723 aa  47.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811968  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  40 
 
 		 259 aa  47.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0868  methylmalonyl-CoA mutase  27.64 
 
 		 715 aa  47.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3591  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.09 
 
 		 143 aa  47.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.53 
 
 		 135 aa  47.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  31.58 
 
 		 136 aa  47.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05680  methylmalonyl-CoA mutase  30.89 
 
 		 726 aa  47.4  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  34.34 
 
 		 1136 aa  47.4  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1223  methylmalonyl-CoA mutase  27.21 
 
 		 712 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2692  methylaspartate mutase subunit S  27.91 
 
 		 144 aa  47  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  36.36 
 
 		 807 aa  47  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4641  cobalamin B12-binding domain protein  30.08 
 
 		 143 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  36.26 
 
 		 219 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  37.36 
 
 		 217 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1263  cobalamin B12-binding domain protein  32.06 
 
 		 149 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.728671  normal  0.8637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2128  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.98 
 
 		 172 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.42 
 
 		 135 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.136466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  35.96 
 
 		 218 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  37.36 
 
 		 211 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  39.13 
 
 		 211 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4403  methylaspartate mutase subunit S  27.01 
 
 		 136 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  37.74 
 
 		 1196 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>