More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2378 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2378  inner-membrane translocator  100 
 
 		 419 aa  813    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2272  inner-membrane translocator  52.28 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.124039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  51.2 
 
 		 420 aa  363  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  50.12 
 
 		 420 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6739  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  54.29 
 
 		 415 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2672  inner-membrane translocator  50.74 
 
 		 427 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00233752  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5291  inner-membrane translocator  50.74 
 
 		 425 aa  329  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1124  inner-membrane translocator  51.44 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0301611  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5346  inner-membrane translocator  46.97 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24370  ABC-type xylose transport system, permease component  46.07 
 
 		 472 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1188  inner-membrane translocator  51.02 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.559412  normal  0.103059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5947  inner-membrane translocator  46.38 
 
 		 438 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  42.21 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1130  inner-membrane translocator  44.75 
 
 		 478 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0384073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1505  inner-membrane translocator  46.19 
 
 		 496 aa  265  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  44.59 
 
 		 409 aa  259  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1573  inner-membrane translocator  39.95 
 
 		 444 aa  256  4e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.984354  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2851  inner-membrane translocator  41.26 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1920  putative ABC transporter transmembrane transport protein  39.81 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.471458  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5185  inner-membrane translocator  43.47 
 
 		 437 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6695  Monosaccharide-transporting ATPase  39.56 
 
 		 496 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159746  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4591  Monosaccharide-transporting ATPase  37.15 
 
 		 419 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.657474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6323  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 419 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7376  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  38.63 
 
 		 419 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  36.19 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3438  inner-membrane translocator  37.95 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0468328  normal  0.179014 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2814  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 414 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.997066  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3703  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.95 
 
 		 415 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4210  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0242  sugar ABC transporter, permease protein  38.9 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0267  sugar ABC transporter, permease protein  38.66 
 
 		 412 aa  186  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0347113  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1971  monosaccharide-transporting ATPase  35.39 
 
 		 402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 397 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  33.87 
 
 		 394 aa  170  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  33.87 
 
 		 394 aa  170  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4283  inner-membrane translocator  40.45 
 
 		 410 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.551304  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 		 394 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  34.44 
 
 		 403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  33.5 
 
 		 394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.71 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  33.51 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  35.68 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  33.92 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  33.08 
 
 		 393 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  33.08 
 
 		 393 aa  159  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0843  inner-membrane translocator  36.32 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1034  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  31.33 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  31.76 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  31.59 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  31.48 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 		 383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.59 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  33.07 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 394 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  33.24 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  33.24 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  33.24 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  33.24 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  33.57 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  32.09 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  32.8 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  32.48 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 452 aa  140  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  30 
 
 		 410 aa  140  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5023  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 396 aa  140  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2702  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  31.18 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  35.45 
 
 		 402 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  35.45 
 
 		 402 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  30.57 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1211  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  31.3 
 
 		 437 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462112  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  32.1 
 
 		 399 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  31.15 
 
 		 414 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  33.16 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  30 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  35.05 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  30.08 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1866  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 405 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0645389  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 432 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  32.11 
 
 		 399 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  29.88 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  29.6 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  32.1 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  31.97 
 
 		 398 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2944  Monosaccharide-transporting ATPase  32.49 
 
 		 408 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293964  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0228  monosaccharide-transporting ATPase  30.24 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>