More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1130 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1130  inner-membrane translocator  100 
 
 		 478 aa  920    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0384073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24370  ABC-type xylose transport system, permease component  49.68 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  49.22 
 
 		 420 aa  354  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  48.99 
 
 		 420 aa  352  7e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2272  inner-membrane translocator  49.1 
 
 		 417 aa  342  9e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.124039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1505  inner-membrane translocator  52.07 
 
 		 496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6739  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  49.32 
 
 		 415 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5947  inner-membrane translocator  44.94 
 
 		 438 aa  310  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2378  inner-membrane translocator  44.75 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5291  inner-membrane translocator  45.11 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5346  inner-membrane translocator  43.55 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2672  inner-membrane translocator  47.54 
 
 		 427 aa  286  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00233752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  36.53 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1124  inner-membrane translocator  54.12 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0301611  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1920  putative ABC transporter transmembrane transport protein  36.96 
 
 		 417 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.471458  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1573  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.984354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2851  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7376  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  35.82 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1188  inner-membrane translocator  51.76 
 
 		 449 aa  203  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.559412  normal  0.103059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6695  Monosaccharide-transporting ATPase  36.65 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159746  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3703  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.75 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3438  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0468328  normal  0.179014 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2814  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 414 aa  182  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.997066  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1971  monosaccharide-transporting ATPase  36.32 
 
 		 402 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4591  Monosaccharide-transporting ATPase  33.41 
 
 		 419 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.657474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6323  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5185  inner-membrane translocator  46.13 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4210  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  30.39 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0843  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 407 aa  137  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  30.54 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  29.77 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  29.77 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  29.77 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 393 aa  134  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  30.73 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  27.4 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.05 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  29.93 
 
 		 381 aa  127  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  27.15 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  28.22 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  27.15 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0267  sugar ABC transporter, permease protein  42.93 
 
 		 412 aa  124  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0347113  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0242  sugar ABC transporter, permease protein  42.93 
 
 		 412 aa  124  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  28.78 
 
 		 396 aa  123  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  28.47 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  26.98 
 
 		 373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  27.74 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  27.8 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  29.68 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  28.7 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  29.2 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2618  inner-membrane translocator  27.8 
 
 		 432 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40748  normal  0.342974 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1034  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  30.51 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  29.3 
 
 		 390 aa  116  8.999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  30.07 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  30.07 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  30.07 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  30.07 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  30.07 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  30.07 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  30.07 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 393 aa  116  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  28.47 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  30.07 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  30.07 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  28.07 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  27.14 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6815  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  31.58 
 
 		 357 aa  110  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  26.64 
 
 		 383 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  28.34 
 
 		 390 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  29.15 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  29.15 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2944  Monosaccharide-transporting ATPase  29.27 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293964  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2702  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 407 aa  107  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  29.13 
 
 		 414 aa  106  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  29.3 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  39.1 
 
 		 331 aa  106  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1049  inner-membrane translocator  38.99 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186781  normal  0.0406542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  43.88 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  26.92 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  27.91 
 
 		 410 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  44.12 
 
 		 348 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 		 322 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4717  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  30.39 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  42.47 
 
 		 346 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  40.53 
 
 		 324 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  26.52 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>