More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1124 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1124  inner-membrane translocator  100 
 
 		 417 aa  790    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0301611  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  68.66 
 
 		 420 aa  537  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  68.18 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2272  inner-membrane translocator  66.18 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.124039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6739  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  66.91 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2378  inner-membrane translocator  51.44 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5947  inner-membrane translocator  51.33 
 
 		 438 aa  350  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5291  inner-membrane translocator  52.79 
 
 		 425 aa  348  9e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2672  inner-membrane translocator  54.85 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00233752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5346  inner-membrane translocator  49.35 
 
 		 428 aa  330  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1188  inner-membrane translocator  50 
 
 		 449 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.559412  normal  0.103059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24370  ABC-type xylose transport system, permease component  47.23 
 
 		 472 aa  316  5e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  43.63 
 
 		 411 aa  306  6e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1505  inner-membrane translocator  47.99 
 
 		 496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1130  inner-membrane translocator  48.97 
 
 		 478 aa  297  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0384073 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1573  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 444 aa  272  9e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.984354  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5185  inner-membrane translocator  43.18 
 
 		 437 aa  252  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7376  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  39.58 
 
 		 419 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1920  putative ABC transporter transmembrane transport protein  39.08 
 
 		 417 aa  243  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.471458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  40 
 
 		 409 aa  242  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6695  Monosaccharide-transporting ATPase  39.7 
 
 		 496 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159746  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 401 aa  239  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2851  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1971  monosaccharide-transporting ATPase  35.22 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3703  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.59 
 
 		 415 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6323  inner-membrane translocator  36.23 
 
 		 419 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3438  inner-membrane translocator  39.7 
 
 		 412 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0468328  normal  0.179014 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4591  Monosaccharide-transporting ATPase  37.28 
 
 		 419 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.657474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4210  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 415 aa  199  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2814  inner-membrane translocator  39.38 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.997066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.81 
 
 		 393 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4283  inner-membrane translocator  43.44 
 
 		 410 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.551304  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 393 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  34.64 
 
 		 383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0843  inner-membrane translocator  36.41 
 
 		 407 aa  182  9.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0242  sugar ABC transporter, permease protein  39.02 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0267  sugar ABC transporter, permease protein  38.78 
 
 		 412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0347113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  34.35 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  33.25 
 
 		 393 aa  180  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  35.75 
 
 		 392 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 392 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  31.39 
 
 		 394 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  31.39 
 
 		 394 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  31.39 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  33.73 
 
 		 405 aa  173  5e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  32.66 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  31.75 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 397 aa  169  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  33.7 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 		 383 aa  167  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  32.8 
 
 		 396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2518  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  30.83 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0258  Monosaccharide-transporting ATPase  33.25 
 
 		 420 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501075  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  34.45 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.35 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  35.26 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  31.93 
 
 		 373 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  30.27 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  36.16 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  35.34 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1034  inner-membrane translocator  36.41 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  36.16 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  34.17 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  34.17 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  34.17 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  34.17 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2944  Monosaccharide-transporting ATPase  35.36 
 
 		 408 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293964  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  33.59 
 
 		 390 aa  155  8e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  29.45 
 
 		 399 aa  155  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  32.42 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  35.33 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  36.12 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  34.7 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 432 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 410 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  30.61 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  33.25 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  35.34 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  29.95 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  32.72 
 
 		 390 aa  146  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  32 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  29.9 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2578  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.270566 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0228  monosaccharide-transporting ATPase  32.97 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 403 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  33.15 
 
 		 389 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  28.54 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 378 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>