More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3703 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3703  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 415 aa  801    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3438  inner-membrane translocator  96.85 
 
 		 412 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0468328  normal  0.179014 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7376  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  75.66 
 
 		 419 aa  551  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6323  inner-membrane translocator  68.35 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4591  Monosaccharide-transporting ATPase  68.59 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.657474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2814  inner-membrane translocator  68.19 
 
 		 414 aa  491  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.997066  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0267  sugar ABC transporter, permease protein  68.52 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0347113  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0242  sugar ABC transporter, permease protein  68.52 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4210  inner-membrane translocator  51.52 
 
 		 415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1920  putative ABC transporter transmembrane transport protein  45.41 
 
 		 417 aa  293  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.471458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  41.71 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2851  inner-membrane translocator  43.31 
 
 		 426 aa  282  9e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  44.96 
 
 		 409 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6695  Monosaccharide-transporting ATPase  40.34 
 
 		 496 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159746  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5185  inner-membrane translocator  45.26 
 
 		 437 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5291  inner-membrane translocator  40.29 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362789 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6739  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  38.94 
 
 		 415 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  38.44 
 
 		 420 aa  227  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2272  inner-membrane translocator  38.35 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.124039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2672  inner-membrane translocator  39.42 
 
 		 427 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00233752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 420 aa  222  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1971  monosaccharide-transporting ATPase  37.89 
 
 		 402 aa  219  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2378  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5346  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1573  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 444 aa  208  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.984354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5947  inner-membrane translocator  35.68 
 
 		 438 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1124  inner-membrane translocator  38.35 
 
 		 417 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0301611  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1130  inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 478 aa  187  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0384073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1034  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 404 aa  179  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24370  ABC-type xylose transport system, permease component  35.35 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0843  inner-membrane translocator  36.95 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1188  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 449 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.559412  normal  0.103059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  32.9 
 
 		 394 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  32.9 
 
 		 394 aa  170  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  32.9 
 
 		 394 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.89 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  34.13 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  33.06 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  32.8 
 
 		 393 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  31.5 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  31.5 
 
 		 383 aa  159  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  33.07 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  33.68 
 
 		 393 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 393 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 394 aa  156  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 393 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 393 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 393 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  33.68 
 
 		 393 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  33.68 
 
 		 393 aa  156  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  35.6 
 
 		 402 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  35.6 
 
 		 402 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  33.68 
 
 		 393 aa  156  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  32.3 
 
 		 396 aa  155  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  30.93 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  33.15 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4283  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 410 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.551304  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  35.58 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  34.3 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  34.3 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  33.42 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  36.41 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  31.23 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.99 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  34.26 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  36.13 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  32.45 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  30.77 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  35.96 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1505  inner-membrane translocator  33.41 
 
 		 496 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  35.77 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  30.68 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  35.77 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  31.9 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  34.95 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  33.91 
 
 		 389 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  31.22 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 378 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  33.43 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  32.47 
 
 		 333 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  36.29 
 
 		 405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  29.31 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.08 
 
 		 427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  30.73 
 
 		 342 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  31.3 
 
 		 405 aa  133  6.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 378 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  32.25 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  30.65 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  29.01 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2618  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40748  normal  0.342974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>