More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4283 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4283  inner-membrane translocator  100 
 
 
410 aa  768    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.551304  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  45.93 
 
 
409 aa  302  8.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  44.97 
 
 
411 aa  293  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  41.37 
 
 
420 aa  282  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  40.91 
 
 
420 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5185  inner-membrane translocator  46.92 
 
 
437 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904236  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1920  putative ABC transporter transmembrane transport protein  45.04 
 
 
417 aa  268  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.471458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2272  inner-membrane translocator  42.16 
 
 
417 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.124039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2851  inner-membrane translocator  44.06 
 
 
426 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  43.77 
 
 
401 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6739  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  42.46 
 
 
415 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.29906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5291  inner-membrane translocator  41.16 
 
 
425 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0362789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5947  inner-membrane translocator  40.88 
 
 
438 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1971  monosaccharide-transporting ATPase  42.36 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2378  inner-membrane translocator  42.42 
 
 
419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6323  inner-membrane translocator  42.6 
 
 
419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47689  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4591  Monosaccharide-transporting ATPase  42.42 
 
 
419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.657474  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6695  Monosaccharide-transporting ATPase  42.37 
 
 
496 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159746  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7376  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  41.6 
 
 
419 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1573  inner-membrane translocator  38.87 
 
 
444 aa  227  3e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.984354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2672  inner-membrane translocator  42.75 
 
 
427 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00233752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5346  inner-membrane translocator  38.62 
 
 
428 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1188  inner-membrane translocator  41.9 
 
 
449 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.559412  normal  0.103059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 
400 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2814  inner-membrane translocator  41.25 
 
 
414 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.997066  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3438  inner-membrane translocator  42.22 
 
 
412 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0468328  normal  0.179014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0843  inner-membrane translocator  43.04 
 
 
407 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3703  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.47 
 
 
415 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  38.54 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  39.03 
 
 
402 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  39.03 
 
 
402 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1505  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
496 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  36.95 
 
 
400 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  36.95 
 
 
400 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0242  sugar ABC transporter, permease protein  42.71 
 
 
412 aa  193  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0267  sugar ABC transporter, permease protein  42.46 
 
 
412 aa  193  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0347113  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1130  inner-membrane translocator  35.68 
 
 
478 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0384073 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  37.65 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1034  inner-membrane translocator  40.7 
 
 
404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4210  inner-membrane translocator  41.78 
 
 
415 aa  190  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  37.53 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  36.71 
 
 
399 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  36.63 
 
 
392 aa  184  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  38.78 
 
 
398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  37.9 
 
 
399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  37.9 
 
 
399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  36.36 
 
 
394 aa  183  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  33.61 
 
 
397 aa  183  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  36.36 
 
 
394 aa  183  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  36.36 
 
 
394 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  39.29 
 
 
399 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24370  ABC-type xylose transport system, permease component  36.12 
 
 
472 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  35.52 
 
 
373 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  35.53 
 
 
399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  35.87 
 
 
393 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  36.02 
 
 
393 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  36.57 
 
 
403 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  35.28 
 
 
392 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2341  sugar ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 
399 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718143  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  38.74 
 
 
405 aa  176  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  33.42 
 
 
388 aa  176  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.75 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  36.84 
 
 
394 aa  173  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  34.78 
 
 
376 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  34.58 
 
 
393 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.32 
 
 
393 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  41.16 
 
 
398 aa  170  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  31.81 
 
 
396 aa  170  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 
389 aa  170  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  31.81 
 
 
383 aa  169  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  34.12 
 
 
383 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 
378 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  33.33 
 
 
357 aa  168  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  36.26 
 
 
378 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  31.73 
 
 
400 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  33.78 
 
 
390 aa  163  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  30.73 
 
 
381 aa  162  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  35.75 
 
 
393 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  36.54 
 
 
378 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  34.51 
 
 
394 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  34.15 
 
 
369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  32.09 
 
 
432 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  32.09 
 
 
432 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  29.43 
 
 
435 aa  156  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  34.58 
 
 
390 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  29.56 
 
 
396 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  35.63 
 
 
393 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  35.63 
 
 
393 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  35.42 
 
 
393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  35.42 
 
 
393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1211  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  33.17 
 
 
437 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462112  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2578  inner-membrane translocator  33.95 
 
 
399 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.270566 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2702  inner-membrane translocator  36.5 
 
 
407 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  32.2 
 
 
405 aa  150  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5023  inner-membrane translocator  33.42 
 
 
396 aa  150  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>