More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0267 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0267  sugar ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 412 aa  798    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0347113  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2814  inner-membrane translocator  88.73 
 
 		 414 aa  645    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.997066  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0242  sugar ABC transporter, permease protein  99.76 
 
 		 412 aa  798    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4591  Monosaccharide-transporting ATPase  75.62 
 
 		 419 aa  594  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.657474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6323  inner-membrane translocator  75.37 
 
 		 419 aa  591  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7376  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  71.85 
 
 		 419 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3703  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  69.25 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3438  inner-membrane translocator  71.36 
 
 		 412 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0468328  normal  0.179014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4210  inner-membrane translocator  51.4 
 
 		 415 aa  307  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1920  putative ABC transporter transmembrane transport protein  46.02 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.471458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  45.66 
 
 		 411 aa  299  7e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2851  inner-membrane translocator  46.58 
 
 		 426 aa  296  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6695  Monosaccharide-transporting ATPase  44.96 
 
 		 496 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159746  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  45.17 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5185  inner-membrane translocator  47.99 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  38.93 
 
 		 420 aa  243  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  39.65 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  40.05 
 
 		 401 aa  237  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6739  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  39.85 
 
 		 415 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5291  inner-membrane translocator  39.16 
 
 		 425 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2272  inner-membrane translocator  38.37 
 
 		 417 aa  232  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.124039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2378  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 419 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1971  monosaccharide-transporting ATPase  39.69 
 
 		 402 aa  225  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1573  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 444 aa  219  5e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.984354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5947  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 438 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2672  inner-membrane translocator  41.21 
 
 		 427 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00233752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5346  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 428 aa  210  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1124  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 417 aa  199  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0301611  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.35 
 
 		 400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  33.51 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1188  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.559412  normal  0.103059 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1034  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 404 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24370  ABC-type xylose transport system, permease component  34.73 
 
 		 472 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0843  inner-membrane translocator  38.96 
 
 		 407 aa  173  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4283  inner-membrane translocator  41.84 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.551304  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1130  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0384073 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  33.17 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  33.17 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  33.17 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  34.55 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  33.78 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  33.16 
 
 		 393 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1505  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 394 aa  152  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  33.87 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  33.87 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  32.52 
 
 		 388 aa  150  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.88 
 
 		 378 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  33.07 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  34.79 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  34.79 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  34.81 
 
 		 398 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 390 aa  145  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  31.3 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  31.52 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  33.6 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  30.63 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  34.31 
 
 		 399 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  30 
 
 		 400 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  30.15 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 378 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  34.15 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  30.31 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  36.84 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  29.8 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  34.59 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  34.59 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  30.59 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  32.11 
 
 		 357 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  34.64 
 
 		 403 aa  133  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  30.62 
 
 		 432 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  32.08 
 
 		 399 aa  133  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 399 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 432 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  33.97 
 
 		 399 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 403 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 346 aa  132  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  34.72 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  33.42 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  33.42 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  31.07 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  30.36 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  31.93 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  32.27 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2618  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40748  normal  0.342974 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>