More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4210 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4210  inner-membrane translocator  100 
 
 		 415 aa  784    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7376  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  53.68 
 
 		 419 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4591  Monosaccharide-transporting ATPase  52.35 
 
 		 419 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.657474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6323  inner-membrane translocator  52.1 
 
 		 419 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3703  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  51.35 
 
 		 415 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3438  inner-membrane translocator  53.94 
 
 		 412 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0468328  normal  0.179014 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2814  inner-membrane translocator  52.72 
 
 		 414 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.997066  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5185  inner-membrane translocator  49.39 
 
 		 437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2851  inner-membrane translocator  45.63 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0242  sugar ABC transporter, permease protein  52.35 
 
 		 412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6695  Monosaccharide-transporting ATPase  46.25 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159746  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0267  sugar ABC transporter, permease protein  51.73 
 
 		 412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0347113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  48.43 
 
 		 409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1920  putative ABC transporter transmembrane transport protein  47.51 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.471458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  45.39 
 
 		 411 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  45.19 
 
 		 420 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  44.8 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6739  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  42.17 
 
 		 415 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2272  inner-membrane translocator  40.53 
 
 		 417 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.124039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5291  inner-membrane translocator  43.38 
 
 		 425 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5947  inner-membrane translocator  41.08 
 
 		 438 aa  253  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2378  inner-membrane translocator  39.52 
 
 		 419 aa  246  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5346  inner-membrane translocator  41.09 
 
 		 428 aa  246  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2672  inner-membrane translocator  44.67 
 
 		 427 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00233752  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1573  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 444 aa  226  7e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.984354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1124  inner-membrane translocator  41.21 
 
 		 417 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0301611  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  39.59 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1188  inner-membrane translocator  44 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.559412  normal  0.103059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1971  monosaccharide-transporting ATPase  37.91 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24370  ABC-type xylose transport system, permease component  36.14 
 
 		 472 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1505  inner-membrane translocator  37.64 
 
 		 496 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1130  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 478 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0384073 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  35.33 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4283  inner-membrane translocator  41.93 
 
 		 410 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.551304  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0843  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 407 aa  170  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 393 aa  169  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  34.04 
 
 		 394 aa  167  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  34.04 
 
 		 394 aa  167  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  34.04 
 
 		 394 aa  166  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1034  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  31.2 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  34.68 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  32.09 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.77 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  35.54 
 
 		 357 aa  160  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  33.94 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.88 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  36.97 
 
 		 399 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  32.36 
 
 		 376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 397 aa  156  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  33.5 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.5 
 
 		 393 aa  154  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  34.56 
 
 		 403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  34.04 
 
 		 393 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  34.04 
 
 		 393 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  34.04 
 
 		 393 aa  152  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 393 aa  152  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 393 aa  152  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 393 aa  152  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  34.04 
 
 		 393 aa  152  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 393 aa  152  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  33.15 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  33.16 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.33 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  33.42 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  34.99 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 369 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  34.19 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  33.97 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  30.21 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 399 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 399 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  31.49 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  33.43 
 
 		 398 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  32.78 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 393 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  34.83 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  34.83 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  35.88 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  32.97 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 403 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  33.25 
 
 		 403 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  35.24 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  31.85 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  32.88 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  35.38 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  32.51 
 
 		 400 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  32.51 
 
 		 400 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  32.5 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2341  sugar ABC transporter, permease protein  35.03 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718143  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 394 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>