More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5947 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5947  inner-membrane translocator  100 
 
 		 438 aa  853    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  53.41 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2272  inner-membrane translocator  54.42 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.124039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  50.69 
 
 		 420 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5291  inner-membrane translocator  48.96 
 
 		 425 aa  336  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6739  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  50.24 
 
 		 415 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1124  inner-membrane translocator  50.81 
 
 		 417 aa  315  9e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0301611  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2672  inner-membrane translocator  52.71 
 
 		 427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00233752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5346  inner-membrane translocator  48.5 
 
 		 428 aa  312  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2378  inner-membrane translocator  46.38 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  44.22 
 
 		 411 aa  282  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1188  inner-membrane translocator  51.42 
 
 		 449 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.559412  normal  0.103059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1505  inner-membrane translocator  44.86 
 
 		 496 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1130  inner-membrane translocator  42.64 
 
 		 478 aa  279  8e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0384073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24370  ABC-type xylose transport system, permease component  42.22 
 
 		 472 aa  259  7e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1573  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.984354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6695  Monosaccharide-transporting ATPase  41.2 
 
 		 496 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159746  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  39.85 
 
 		 409 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5185  inner-membrane translocator  41.62 
 
 		 437 aa  226  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2851  inner-membrane translocator  38.42 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1920  putative ABC transporter transmembrane transport protein  38.63 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.471458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6323  inner-membrane translocator  36.76 
 
 		 419 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7376  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  38.16 
 
 		 419 aa  216  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4591  Monosaccharide-transporting ATPase  36.78 
 
 		 419 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.657474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4210  inner-membrane translocator  40.74 
 
 		 415 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2814  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.997066  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3703  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 415 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1971  monosaccharide-transporting ATPase  36.82 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0267  sugar ABC transporter, permease protein  38.56 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0347113  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0242  sugar ABC transporter, permease protein  38.81 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3438  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 412 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0468328  normal  0.179014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4283  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.551304  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  36.01 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  32.73 
 
 		 396 aa  170  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  32.74 
 
 		 383 aa  167  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 393 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  35.19 
 
 		 392 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  31.71 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.7 
 
 		 393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  34 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  34.63 
 
 		 394 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  34.63 
 
 		 394 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  34.63 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  33.91 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  34.4 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  33.59 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  33.51 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  32.92 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  34.59 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  32.05 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  33.6 
 
 		 357 aa  154  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  34.11 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  32.23 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  33.59 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  34.11 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 		 393 aa  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  34.11 
 
 		 393 aa  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 		 393 aa  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 		 393 aa  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 		 393 aa  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 		 393 aa  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  34.11 
 
 		 393 aa  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4475  monosaccharide-transporting ATPase  31.44 
 
 		 404 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.826899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  32.59 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  33.51 
 
 		 389 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4717  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 412 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.02 
 
 		 400 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  35.55 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1180  Monosaccharide-transporting ATPase  33.74 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  31.89 
 
 		 403 aa  144  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 420 aa  143  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 432 aa  143  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  33.6 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  33.6 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.16 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2944  Monosaccharide-transporting ATPase  34.84 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293964  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0739  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1866  inner-membrane translocator  36.32 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0645389  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 403 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  30.53 
 
 		 403 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  33.69 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2518  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  34.67 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.42 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  30.05 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  30.15 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  35.04 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0843  inner-membrane translocator  36.87 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.37 
 
 		 427 aa  136  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2252  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>