93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1702 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1702  Phage integrase  100 
 
 		 660 aa  1337    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1278  phage integrase  29.75 
 
 		 677 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3807  phage integrase  31.61 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3808  hypothetical protein  24.5 
 
 		 325 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  23.45 
 
 		 743 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.66 
 
 		 724 aa  58.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.66 
 
 		 726 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  22.75 
 
 		 741 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  23.73 
 
 		 774 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  22.64 
 
 		 802 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  19.96 
 
 		 753 aa  54.3  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  23.56 
 
 		 750 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.46 
 
 		 720 aa  53.9  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  20.18 
 
 		 734 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  24 
 
 		 282 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  26.49 
 
 		 381 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  26.49 
 
 		 381 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  23.47 
 
 		 715 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  19.81 
 
 		 756 aa  52.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 336 aa  52  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  25.95 
 
 		 381 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  23.3 
 
 		 773 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.89 
 
 		 548 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5043  integrase family protein  28.78 
 
 		 160 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  23.81 
 
 		 738 aa  50.4  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.89 
 
 		 537 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  22.2 
 
 		 713 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  23.49 
 
 		 709 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  26.45 
 
 		 305 aa  49.7  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  27.15 
 
 		 343 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  22.37 
 
 		 769 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 643 aa  48.9  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  28.48 
 
 		 337 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  28.39 
 
 		 304 aa  47.4  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 642 aa  46.6  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  23 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 		 766 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.77 
 
 		 737 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  26.35 
 
 		 398 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  24.29 
 
 		 295 aa  46.2  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 737 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  23.53 
 
 		 734 aa  45.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3175  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.52 
 
 		 710 aa  45.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.659876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.25 
 
 		 298 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 299 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.25 
 
 		 298 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.25 
 
 		 298 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 299 aa  45.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  22.14 
 
 		 742 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  23.27 
 
 		 720 aa  45.8  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  27.34 
 
 		 294 aa  45.8  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.25 
 
 		 298 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 299 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 784 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  23.14 
 
 		 302 aa  45.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  20.51 
 
 		 772 aa  45.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  24.27 
 
 		 310 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.52 
 
 		 298 aa  44.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  25.52 
 
 		 298 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  25.52 
 
 		 298 aa  44.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.52 
 
 		 298 aa  44.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.52 
 
 		 298 aa  44.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  22.9 
 
 		 527 aa  44.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.52 
 
 		 298 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.52 
 
 		 298 aa  44.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 279 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  23.38 
 
 		 472 aa  44.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  21.81 
 
 		 711 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.75 
 
 		 298 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.52 
 
 		 298 aa  44.7  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1492  phage integrase family protein  31.3 
 
 		 134 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  25.95 
 
 		 333 aa  44.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.52 
 
 		 298 aa  44.7  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 804 aa  44.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  24.16 
 
 		 305 aa  44.3  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 319 aa  44.3  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 295 aa  44.3  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.08 
 
 		 324 aa  44.3  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.18 
 
 		 336 aa  44.3  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  22.75 
 
 		 302 aa  44.3  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 		 301 aa  44.3  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 297 aa  44.3  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  24.46 
 
 		 308 aa  43.9  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  26.32 
 
 		 334 aa  44.3  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  23.36 
 
 		 739 aa  43.9  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  26.26 
 
 		 311 aa  43.9  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3304  lipopolysaccharide biosynthesis  22.28 
 
 		 663 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.417507  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.3 
 
 		 507 aa  43.9  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 804 aa  43.9  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.03 
 
 		 478 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  25 
 
 		 292 aa  43.9  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 701 aa  43.9  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>