More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1967 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1967  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter  100 
 
 		 236 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000802413  unclonable  0.0000000310051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.35 
 
 		 626 aa  83.2  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  27.24 
 
 		 618 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  29.2 
 
 		 611 aa  72  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  26.21 
 
 		 594 aa  71.6  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  31.23 
 
 		 623 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  25.41 
 
 		 604 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  25.29 
 
 		 613 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1541  ABC transporter ATP-binding protein  26.07 
 
 		 597 aa  67.8  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  28.29 
 
 		 618 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  23.08 
 
 		 622 aa  66.6  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  27.27 
 
 		 623 aa  65.5  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  27.97 
 
 		 610 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  27.97 
 
 		 610 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2585  ABC transporter related  25.96 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  26.67 
 
 		 595 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1695  ABC transporter related  27.08 
 
 		 593 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.68 
 
 		 610 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  25 
 
 		 609 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1736  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.36 
 
 		 608 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609322  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  33.33 
 
 		 1284 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  27.09 
 
 		 575 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  27.85 
 
 		 725 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  30.42 
 
 		 599 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0350  ATPase  25.1 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  24.05 
 
 		 575 aa  62  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  26.29 
 
 		 587 aa  62  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3208  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  25.87 
 
 		 625 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333533  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  22.26 
 
 		 604 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3656  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  24.79 
 
 		 608 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0881594  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  25.59 
 
 		 609 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  28.69 
 
 		 596 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  24.81 
 
 		 1675 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  28.38 
 
 		 1018 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0659  ABC transporter, ATP-binding protein  27.92 
 
 		 594 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000175742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  24.3 
 
 		 719 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  25.51 
 
 		 634 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  24.7 
 
 		 619 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  28.51 
 
 		 652 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  25 
 
 		 622 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.73 
 
 		 1018 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  29.91 
 
 		 588 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  30.67 
 
 		 622 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  24.8 
 
 		 609 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  26.54 
 
 		 646 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  27.97 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4659  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  26.82 
 
 		 596 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.265445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  30.32 
 
 		 668 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  28.1 
 
 		 598 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.35 
 
 		 574 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.35 
 
 		 575 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3382  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  23.11 
 
 		 574 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000301106 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.35 
 
 		 575 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1665  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  26.46 
 
 		 578 aa  58.9  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0230718  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.35 
 
 		 596 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  26.32 
 
 		 611 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.35 
 
 		 574 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3393  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.94 
 
 		 605 aa  59.3  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.025265 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.35 
 
 		 575 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.35 
 
 		 596 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4088  ABC transporter-like  25.42 
 
 		 605 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.66 
 
 		 589 aa  58.9  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  25 
 
 		 592 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  24.62 
 
 		 585 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05641  putative multidrug efflux ABC transporter  28.35 
 
 		 599 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  25.22 
 
 		 610 aa  58.5  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0029  ABC transporter ATP-binding protein  21.13 
 
 		 592 aa  58.5  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0444277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  24.24 
 
 		 613 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1427  ABC transporter-like  24.71 
 
 		 610 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.582294  normal  0.104251 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  24.8 
 
 		 609 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  25.66 
 
 		 617 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  22.08 
 
 		 633 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  25.99 
 
 		 623 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5437  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 914 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.04493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0190  ABC transporter related  26.89 
 
 		 608 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603074  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  29.1 
 
 		 597 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  24.9 
 
 		 626 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  24.41 
 
 		 609 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  24.41 
 
 		 609 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2054  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.78 
 
 		 593 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4049  ABC transporter related  25.68 
 
 		 610 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1806  transport ATP-binding protein CydD  23.11 
 
 		 574 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1255  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.63 
 
 		 597 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261223  normal  0.738985 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.2 
 
 		 586 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.71 
 
 		 579 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1946  transport ATP-binding protein CydD  23.11 
 
 		 574 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.64 
 
 		 596 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1946  transport ATP-binding protein CydD  22.69 
 
 		 574 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  28.9 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  24.02 
 
 		 609 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  26.55 
 
 		 603 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  25.3 
 
 		 738 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  25.2 
 
 		 609 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.2 
 
 		 586 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  25.77 
 
 		 625 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1979  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.75 
 
 		 589 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5068  ABC transporter related  33.04 
 
 		 666 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.427212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1981  transport ATP-binding protein CydD  22.27 
 
 		 574 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.47079e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  24.8 
 
 		 609 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  28.39 
 
 		 666 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>