More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3116 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  100 
 
 		 610 aa  1244    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  34.22 
 
 		 618 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  33.83 
 
 		 603 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  33.83 
 
 		 603 aa  365  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3067  ABC transporter related  33.28 
 
 		 616 aa  319  7.999999999999999e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000774728  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  32.22 
 
 		 594 aa  305  2.0000000000000002e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  32.34 
 
 		 622 aa  297  3e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2522  ABC transporter, ATP-binding protein  34.64 
 
 		 608 aa  297  4e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000536848  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0029  ABC transporter ATP-binding protein  31.17 
 
 		 592 aa  295  1e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0444277  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  29.81 
 
 		 594 aa  293  6e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  30.38 
 
 		 596 aa  263  8e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  29.72 
 
 		 624 aa  258  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  36.75 
 
 		 606 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  31.76 
 
 		 596 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  35.83 
 
 		 593 aa  254  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1188  ABC transporter related  29.93 
 
 		 579 aa  242  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000012355  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  28.92 
 
 		 588 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  27.83 
 
 		 626 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  35.95 
 
 		 611 aa  231  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  33.77 
 
 		 614 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  29.2 
 
 		 604 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  28.16 
 
 		 613 aa  221  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1189  ABC transporter related  33.41 
 
 		 586 aa  217  5e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00259948  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  36.28 
 
 		 611 aa  213  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  32.9 
 
 		 625 aa  211  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  26.38 
 
 		 623 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  29.38 
 
 		 592 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  35.2 
 
 		 608 aa  211  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2524  ABC transporter, ATP-binding protein  31.4 
 
 		 423 aa  210  8e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00646333  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  28.57 
 
 		 609 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  29.24 
 
 		 638 aa  207  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  30.48 
 
 		 619 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.69 
 
 		 587 aa  204  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  28.26 
 
 		 625 aa  204  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  33.43 
 
 		 615 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  27.24 
 
 		 616 aa  204  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  29.83 
 
 		 604 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  41.77 
 
 		 618 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  33.54 
 
 		 615 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.24 
 
 		 600 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  40.24 
 
 		 618 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  40.24 
 
 		 625 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  40.24 
 
 		 618 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  40 
 
 		 627 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  39.13 
 
 		 621 aa  194  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.69 
 
 		 633 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  32.72 
 
 		 595 aa  190  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  29.85 
 
 		 619 aa  190  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  33.44 
 
 		 605 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  38.84 
 
 		 621 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  38.84 
 
 		 621 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  38.84 
 
 		 621 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  27.09 
 
 		 611 aa  189  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.5 
 
 		 573 aa  188  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2691  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.47 
 
 		 573 aa  188  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0993753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  34.04 
 
 		 626 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.3 
 
 		 586 aa  187  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  38.31 
 
 		 607 aa  187  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  40.07 
 
 		 607 aa  187  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  26.93 
 
 		 626 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 611 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.54 
 
 		 586 aa  186  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  31.8 
 
 		 623 aa  186  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  30.86 
 
 		 606 aa  186  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  40.53 
 
 		 597 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  34.23 
 
 		 584 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  29.25 
 
 		 613 aa  185  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  39.29 
 
 		 599 aa  185  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  38.78 
 
 		 592 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1061  ABC transporter related  28.94 
 
 		 592 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.18 
 
 		 594 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.51 
 
 		 581 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  39.84 
 
 		 625 aa  184  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  39.26 
 
 		 575 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  30.11 
 
 		 619 aa  183  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  35.96 
 
 		 584 aa  183  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  30.62 
 
 		 500 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.17 
 
 		 574 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  29.72 
 
 		 586 aa  182  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.28 
 
 		 587 aa  182  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.17 
 
 		 574 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  32.57 
 
 		 618 aa  182  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.18 
 
 		 589 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.74 
 
 		 587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  34.45 
 
 		 598 aa  181  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 616 aa  181  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  36.9 
 
 		 626 aa  181  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  30.38 
 
 		 596 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  30.52 
 
 		 737 aa  180  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3122  ABC transporter-like protein protein  29.57 
 
 		 609 aa  180  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  36.73 
 
 		 617 aa  180  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  40 
 
 		 590 aa  179  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1979  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.84 
 
 		 589 aa  180  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.9 
 
 		 586 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  28.67 
 
 		 586 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.14 
 
 		 586 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  34.23 
 
 		 647 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.73 
 
 		 590 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  37.74 
 
 		 607 aa  179  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.67 
 
 		 586 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>