More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1278 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  100 
 
 		 617 aa  1212    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  88.82 
 
 		 611 aa  1035    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  35.47 
 
 		 627 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 623 aa  286  9e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 616 aa  249  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.79 
 
 		 600 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  33.09 
 
 		 621 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  28.29 
 
 		 592 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  30.49 
 
 		 623 aa  230  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  30.52 
 
 		 613 aa  229  9e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  28.18 
 
 		 566 aa  229  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  32.05 
 
 		 625 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  30.02 
 
 		 605 aa  228  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  36.36 
 
 		 625 aa  223  9e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  30.49 
 
 		 608 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  34.44 
 
 		 626 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  30 
 
 		 613 aa  220  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  28.27 
 
 		 611 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  32.32 
 
 		 615 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  32.24 
 
 		 609 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  33.59 
 
 		 616 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  37.9 
 
 		 590 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  27.95 
 
 		 611 aa  216  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  33.91 
 
 		 618 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  31.5 
 
 		 619 aa  216  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  28.33 
 
 		 614 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  35.87 
 
 		 618 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  32.68 
 
 		 626 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  32.61 
 
 		 625 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  29.49 
 
 		 604 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  30.66 
 
 		 621 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  32.36 
 
 		 618 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  24.79 
 
 		 597 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  29.89 
 
 		 616 aa  212  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  35.25 
 
 		 618 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  30.56 
 
 		 621 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  33.2 
 
 		 623 aa  211  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  30 
 
 		 619 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  31 
 
 		 621 aa  210  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08280  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  33.33 
 
 		 607 aa  208  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0133225  normal  0.224616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  30.36 
 
 		 618 aa  206  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  31.14 
 
 		 603 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  33.45 
 
 		 599 aa  205  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  32.5 
 
 		 606 aa  205  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  33.84 
 
 		 596 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  26.78 
 
 		 603 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.62 
 
 		 603 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  26.78 
 
 		 603 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  35.63 
 
 		 673 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  43.95 
 
 		 647 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  31.75 
 
 		 615 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  33.86 
 
 		 638 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  43.58 
 
 		 578 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  39.22 
 
 		 631 aa  196  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  29.17 
 
 		 606 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  29.98 
 
 		 611 aa  192  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  25 
 
 		 608 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  30.29 
 
 		 626 aa  190  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.78 
 
 		 594 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1839  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 590 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298926  normal  0.0982891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  30.21 
 
 		 605 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  29.93 
 
 		 606 aa  186  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  39.44 
 
 		 626 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  25.52 
 
 		 591 aa  182  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  39.29 
 
 		 619 aa  182  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.71 
 
 		 633 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.28 
 
 		 587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  39.39 
 
 		 595 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.45 
 
 		 590 aa  180  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  36.73 
 
 		 610 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  41.04 
 
 		 653 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.03 
 
 		 579 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  29.88 
 
 		 594 aa  179  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  39.06 
 
 		 662 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  25.62 
 
 		 588 aa  178  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  27.3 
 
 		 596 aa  178  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  40.23 
 
 		 579 aa  177  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  31.6 
 
 		 633 aa  177  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  30.23 
 
 		 631 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2522  ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 		 608 aa  175  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000536848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  26.05 
 
 		 596 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  33.53 
 
 		 627 aa  173  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  30.8 
 
 		 619 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.37 
 
 		 596 aa  172  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  28.39 
 
 		 603 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.31 
 
 		 587 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  25.87 
 
 		 604 aa  172  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.89 
 
 		 606 aa  172  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 604 aa  171  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  43.4 
 
 		 607 aa  171  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  39.62 
 
 		 580 aa  170  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.41 
 
 		 613 aa  170  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  39.92 
 
 		 500 aa  170  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  33.09 
 
 		 665 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  29.96 
 
 		 603 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  36.59 
 
 		 618 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  35.71 
 
 		 1018 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  40.24 
 
 		 753 aa  169  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.6 
 
 		 581 aa  168  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2524  ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 		 423 aa  168  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00646333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>