More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2524 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2524  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 423 aa  852    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00646333  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  52.31 
 
 		 624 aa  385  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 		 625 aa  330  3e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  48.48 
 
 		 626 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 596 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 596 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  44.34 
 
 		 606 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  39.9 
 
 		 603 aa  272  9e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  39.9 
 
 		 603 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  36.59 
 
 		 594 aa  259  5.0000000000000005e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2522  ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 		 608 aa  251  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000536848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  33.72 
 
 		 593 aa  239  9e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  32.49 
 
 		 618 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3067  ABC transporter related  36 
 
 		 616 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000774728  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0029  ABC transporter ATP-binding protein  35.62 
 
 		 592 aa  231  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0444277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  36.62 
 
 		 623 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  33.96 
 
 		 622 aa  221  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  43.32 
 
 		 604 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  32.88 
 
 		 610 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  44.98 
 
 		 625 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  34.11 
 
 		 625 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  34.71 
 
 		 594 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1189  ABC transporter related  33.25 
 
 		 586 aa  206  8e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00259948  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  34.94 
 
 		 616 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  40.32 
 
 		 599 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  38.2 
 
 		 611 aa  199  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  32.11 
 
 		 592 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.32 
 
 		 587 aa  197  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  34.93 
 
 		 611 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  32.11 
 
 		 588 aa  196  6e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  35.84 
 
 		 604 aa  196  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  32.72 
 
 		 621 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  32.29 
 
 		 623 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  33.33 
 
 		 619 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  32.42 
 
 		 621 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  32.42 
 
 		 621 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1188  ABC transporter related  37.39 
 
 		 579 aa  192  9e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000012355  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.34 
 
 		 600 aa  192  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  33.64 
 
 		 614 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  34.88 
 
 		 609 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  31.9 
 
 		 613 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  32.83 
 
 		 618 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  31.83 
 
 		 618 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  31.83 
 
 		 618 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  32.73 
 
 		 611 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  32.13 
 
 		 615 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  39.61 
 
 		 615 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  31.67 
 
 		 596 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  34.15 
 
 		 603 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  36.11 
 
 		 638 aa  177  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  31.78 
 
 		 621 aa  176  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  31.11 
 
 		 626 aa  176  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  33.07 
 
 		 566 aa  175  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 608 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0185  ABC transporter ATP-binding protein  39.34 
 
 		 585 aa  173  5e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.55 
 
 		 603 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  36.25 
 
 		 597 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  36.9 
 
 		 625 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  29.47 
 
 		 613 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  28.97 
 
 		 626 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  29.19 
 
 		 611 aa  170  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  34.1 
 
 		 617 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1021  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  31.21 
 
 		 573 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000555337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  31.6 
 
 		 605 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0961  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  31.21 
 
 		 573 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446382  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1070  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  31.21 
 
 		 573 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  38.93 
 
 		 580 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1055  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  31.21 
 
 		 573 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  36.89 
 
 		 606 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0989  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  31.21 
 
 		 573 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2443  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  30.72 
 
 		 573 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0221682  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0184  ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 		 586 aa  166  6.9999999999999995e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.44 
 
 		 582 aa  166  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2235  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  30.72 
 
 		 573 aa  166  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.228638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  36.4 
 
 		 727 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  35.02 
 
 		 627 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00890  fused cysteine transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  30.42 
 
 		 573 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.140695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  34.81 
 
 		 582 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.81 
 
 		 582 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 611 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.81 
 
 		 582 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  34.81 
 
 		 582 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00897  hypothetical protein  30.42 
 
 		 573 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.81 
 
 		 582 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.81 
 
 		 582 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.81 
 
 		 582 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.81 
 
 		 582 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.81 
 
 		 582 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2710  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  30.42 
 
 		 573 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00743956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  36.11 
 
 		 608 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 		 600 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  38.37 
 
 		 598 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  34.01 
 
 		 598 aa  163  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  30.3 
 
 		 618 aa  163  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  41.08 
 
 		 759 aa  163  7e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  35.02 
 
 		 586 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1048  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  30.72 
 
 		 573 aa  162  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00703817  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2757  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  30.12 
 
 		 573 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000336134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0990  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  30.12 
 
 		 573 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.034293  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  35.42 
 
 		 591 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>