More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00656 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 626 aa  1251    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  62.95 
 
 		 618 aa  711    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  67.43 
 
 		 615 aa  783    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  80.92 
 
 		 623 aa  915    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  65.62 
 
 		 615 aa  732    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  62.07 
 
 		 618 aa  705    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  67.53 
 
 		 619 aa  808    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  54.74 
 
 		 611 aa  675    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  62.79 
 
 		 618 aa  709    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  55.11 
 
 		 616 aa  668    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  55.88 
 
 		 638 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  45.11 
 
 		 623 aa  509  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  41.39 
 
 		 609 aa  450  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  41.63 
 
 		 625 aa  452  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  40.74 
 
 		 625 aa  444  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  41.13 
 
 		 604 aa  439  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  40.29 
 
 		 621 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 621 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  40.13 
 
 		 621 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  39.23 
 
 		 611 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  36.99 
 
 		 614 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  39.36 
 
 		 603 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.48 
 
 		 603 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  40.13 
 
 		 625 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  35.49 
 
 		 592 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  37.19 
 
 		 613 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  35.66 
 
 		 618 aa  347  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.9 
 
 		 600 aa  345  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  34.85 
 
 		 613 aa  336  7.999999999999999e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  35.25 
 
 		 605 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  35.18 
 
 		 608 aa  299  8e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  36.53 
 
 		 616 aa  296  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  34.65 
 
 		 619 aa  293  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  38.04 
 
 		 621 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  30.26 
 
 		 605 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  35.61 
 
 		 608 aa  290  8e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 626 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  33.79 
 
 		 606 aa  287  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  30.6 
 
 		 597 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.77 
 
 		 633 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  36.84 
 
 		 626 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  31.97 
 
 		 611 aa  266  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  32.34 
 
 		 595 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  35.83 
 
 		 662 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  26.83 
 
 		 603 aa  263  8e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  26.67 
 
 		 603 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  35.92 
 
 		 599 aa  259  8e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  31.01 
 
 		 608 aa  257  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  28.79 
 
 		 566 aa  256  8e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  28.29 
 
 		 604 aa  253  6e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  34.06 
 
 		 616 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  32.58 
 
 		 627 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  35.77 
 
 		 578 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  36.93 
 
 		 500 aa  249  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  34.13 
 
 		 665 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  29.59 
 
 		 618 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  35.13 
 
 		 647 aa  242  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  36.2 
 
 		 631 aa  236  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.32 
 
 		 587 aa  236  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  28.55 
 
 		 596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  29.39 
 
 		 594 aa  234  5e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  26.85 
 
 		 606 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  34.75 
 
 		 633 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 		 596 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  28.94 
 
 		 624 aa  228  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  32.67 
 
 		 653 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  36.58 
 
 		 623 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  29.43 
 
 		 593 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  32.54 
 
 		 590 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  33.52 
 
 		 611 aa  223  8e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.77 
 
 		 596 aa  220  6e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  44.03 
 
 		 626 aa  220  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  34.31 
 
 		 673 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  29.1 
 
 		 611 aa  219  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  33.2 
 
 		 611 aa  219  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.44 
 
 		 608 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  34.68 
 
 		 610 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2019  ABC transporter related  31.88 
 
 		 590 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.990408 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.91 
 
 		 584 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.68 
 
 		 609 aa  218  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.95 
 
 		 590 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  29.35 
 
 		 622 aa  217  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  36.39 
 
 		 626 aa  216  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0029  ABC transporter ATP-binding protein  31.57 
 
 		 592 aa  216  9e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0444277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  33.91 
 
 		 636 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  31.47 
 
 		 601 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3873  ABC transporter related  32.2 
 
 		 623 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  41.76 
 
 		 575 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 620 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  36.14 
 
 		 604 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  33.07 
 
 		 617 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  45.53 
 
 		 565 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.09 
 
 		 587 aa  213  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  27.38 
 
 		 591 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.16 
 
 		 567 aa  213  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  36.52 
 
 		 625 aa  212  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.18 
 
 		 614 aa  212  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  36.87 
 
 		 607 aa  212  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.71 
 
 		 579 aa  211  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.39 
 
 		 580 aa  211  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>