More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0404 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  58.57 
 
 		 603 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  58.67 
 
 		 603 aa  680    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  64.7 
 
 		 604 aa  823    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  61.27 
 
 		 611 aa  744    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  100 
 
 		 609 aa  1224    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  51.41 
 
 		 621 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  51.17 
 
 		 621 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  51.01 
 
 		 621 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  48.68 
 
 		 623 aa  556  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  49.83 
 
 		 625 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  50.74 
 
 		 625 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  49.49 
 
 		 625 aa  521  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  43.99 
 
 		 616 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  41.83 
 
 		 611 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  40.95 
 
 		 619 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  41.4 
 
 		 608 aa  445  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  40.62 
 
 		 615 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  41.23 
 
 		 626 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  43.14 
 
 		 623 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  40.78 
 
 		 618 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  40.72 
 
 		 618 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  39.32 
 
 		 614 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  41.27 
 
 		 618 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  40.39 
 
 		 615 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  38.15 
 
 		 592 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  39.83 
 
 		 613 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  37.4 
 
 		 613 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  40.7 
 
 		 638 aa  382  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.87 
 
 		 600 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  36.6 
 
 		 618 aa  352  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  36.73 
 
 		 626 aa  339  7e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  37.18 
 
 		 606 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  35.76 
 
 		 605 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 608 aa  316  8e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  32.08 
 
 		 605 aa  310  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  29.03 
 
 		 608 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  33.67 
 
 		 621 aa  299  9e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  31.79 
 
 		 566 aa  293  7e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  36.89 
 
 		 578 aa  288  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  34.38 
 
 		 619 aa  287  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  33.11 
 
 		 626 aa  283  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.95 
 
 		 633 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  34.58 
 
 		 616 aa  280  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  34.11 
 
 		 662 aa  277  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  27.41 
 
 		 597 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  34.06 
 
 		 616 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  37.04 
 
 		 599 aa  266  7e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  32.22 
 
 		 673 aa  257  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  32.21 
 
 		 595 aa  256  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.79 
 
 		 587 aa  256  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  28.09 
 
 		 594 aa  254  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  31.74 
 
 		 631 aa  253  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  32.45 
 
 		 633 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  28.04 
 
 		 591 aa  251  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  27.8 
 
 		 603 aa  247  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  27.48 
 
 		 603 aa  246  8e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  29.72 
 
 		 606 aa  246  9e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  33.33 
 
 		 627 aa  246  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  30.29 
 
 		 611 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  33.14 
 
 		 626 aa  242  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  31.24 
 
 		 593 aa  237  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  29.17 
 
 		 604 aa  236  9e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  28.67 
 
 		 618 aa  230  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  31.19 
 
 		 619 aa  229  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 		 596 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  32.15 
 
 		 665 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  28.23 
 
 		 596 aa  226  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  37.03 
 
 		 500 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  31.02 
 
 		 611 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  35.04 
 
 		 604 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  30.61 
 
 		 619 aa  221  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  34.51 
 
 		 590 aa  220  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  28.91 
 
 		 626 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  45.49 
 
 		 596 aa  216  9e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  30.35 
 
 		 623 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  30.6 
 
 		 611 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  28.97 
 
 		 596 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  31.66 
 
 		 617 aa  213  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1839  ABC transporter related protein  35.63 
 
 		 590 aa  212  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298926  normal  0.0982891 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  28.01 
 
 		 624 aa  211  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.67 
 
 		 582 aa  210  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  31.19 
 
 		 647 aa  208  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  32.3 
 
 		 653 aa  207  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  27.72 
 
 		 631 aa  206  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  30.04 
 
 		 588 aa  206  8e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.63 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.23 
 
 		 582 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11298  drug ABC transporter ATP-binding protein  31.67 
 
 		 631 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  28.29 
 
 		 610 aa  204  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  33.62 
 
 		 625 aa  203  8e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  29.94 
 
 		 720 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  30.09 
 
 		 582 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.09 
 
 		 582 aa  201  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.09 
 
 		 582 aa  201  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.09 
 
 		 582 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.09 
 
 		 582 aa  201  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.09 
 
 		 582 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  38.29 
 
 		 594 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.09 
 
 		 582 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  30.09 
 
 		 582 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>