More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2200 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  100 
 
 		 626 aa  1286    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  43.61 
 
 		 625 aa  518  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  36.49 
 
 		 624 aa  418  9.999999999999999e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 596 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 		 596 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  34.04 
 
 		 606 aa  339  8e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2524  ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00646333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  30.93 
 
 		 603 aa  310  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 		 603 aa  310  5.9999999999999995e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  32.15 
 
 		 594 aa  306  5.0000000000000004e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  29.66 
 
 		 593 aa  279  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  40.55 
 
 		 618 aa  271  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2522  ABC transporter, ATP-binding protein  26.87 
 
 		 608 aa  240  5.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000536848  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  38.17 
 
 		 625 aa  239  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  39.76 
 
 		 625 aa  239  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  34.18 
 
 		 610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  28.52 
 
 		 614 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0029  ABC transporter ATP-binding protein  32.38 
 
 		 592 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0444277  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  27.67 
 
 		 622 aa  223  7e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  28.11 
 
 		 588 aa  223  8e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  28.91 
 
 		 616 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  43.78 
 
 		 594 aa  222  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  36.2 
 
 		 623 aa  221  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  41.83 
 
 		 611 aa  220  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3067  ABC transporter related  27.53 
 
 		 616 aa  220  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000774728  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  28.91 
 
 		 609 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  36.59 
 
 		 621 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  35.85 
 
 		 592 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  35.98 
 
 		 621 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  35.98 
 
 		 621 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  35.86 
 
 		 604 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  36.89 
 
 		 611 aa  213  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  33.33 
 
 		 613 aa  211  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1189  ABC transporter related  26.62 
 
 		 586 aa  209  9e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00259948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  37.27 
 
 		 615 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  36.61 
 
 		 619 aa  206  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  35.43 
 
 		 608 aa  205  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  34.39 
 
 		 604 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  35.87 
 
 		 625 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  36.12 
 
 		 621 aa  201  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  35.69 
 
 		 611 aa  196  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  35.87 
 
 		 615 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  35.56 
 
 		 618 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  35.94 
 
 		 599 aa  195  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.11 
 
 		 600 aa  194  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  33.44 
 
 		 566 aa  194  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  33.04 
 
 		 597 aa  194  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  35.67 
 
 		 618 aa  194  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  35.67 
 
 		 618 aa  193  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  35.4 
 
 		 605 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  28.57 
 
 		 616 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  26.81 
 
 		 619 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 		 582 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  32.15 
 
 		 626 aa  187  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  34.98 
 
 		 606 aa  187  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  33.43 
 
 		 618 aa  186  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 623 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  29.25 
 
 		 638 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  34.65 
 
 		 623 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  34.75 
 
 		 613 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.96 
 
 		 587 aa  184  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  30.44 
 
 		 626 aa  183  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1188  ABC transporter related  33.9 
 
 		 579 aa  182  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000012355  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  32.15 
 
 		 582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.15 
 
 		 582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1255  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.29 
 
 		 597 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261223  normal  0.738985 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.15 
 
 		 582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.15 
 
 		 582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.15 
 
 		 582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  34.36 
 
 		 598 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.15 
 
 		 582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.15 
 
 		 582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  32.15 
 
 		 582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.15 
 
 		 582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  32.92 
 
 		 603 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.97 
 
 		 583 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.56 
 
 		 593 aa  180  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1695  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.56 
 
 		 623 aa  180  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.733558  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.45 
 
 		 582 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2307  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.56 
 
 		 583 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  33.23 
 
 		 584 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.09 
 
 		 594 aa  178  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  32.83 
 
 		 603 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.13 
 
 		 602 aa  177  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  30.7 
 
 		 597 aa  177  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.13 
 
 		 606 aa  176  8e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0389  ABC transporter ATP-binding protein  32.26 
 
 		 582 aa  176  9e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  34.87 
 
 		 633 aa  176  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.56 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.56 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.56 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.56 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  33.33 
 
 		 605 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.56 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  33.12 
 
 		 591 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  26.19 
 
 		 618 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  27.62 
 
 		 600 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.35 
 
 		 592 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0353  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.26 
 
 		 582 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693994  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  32.15 
 
 		 592 aa  175  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>