More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3066 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  100 
 
 		 593 aa  1211    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  41.29 
 
 		 596 aa  425  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 596 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  35.49 
 
 		 603 aa  332  9e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  33.61 
 
 		 588 aa  332  2e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  35.31 
 
 		 603 aa  330  6e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  34.18 
 
 		 594 aa  325  2e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  37 
 
 		 606 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  29.17 
 
 		 626 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3067  ABC transporter related  33.33 
 
 		 616 aa  276  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000774728  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  31.02 
 
 		 624 aa  270  7e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1189  ABC transporter related  30.62 
 
 		 586 aa  268  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00259948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  30.39 
 
 		 618 aa  260  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  28.28 
 
 		 614 aa  256  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  33 
 
 		 610 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 		 625 aa  248  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  31.24 
 
 		 609 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  29.89 
 
 		 613 aa  239  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  31.65 
 
 		 592 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0029  ABC transporter ATP-binding protein  29.9 
 
 		 592 aa  239  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0444277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  28.83 
 
 		 623 aa  239  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  32.43 
 
 		 622 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  30.02 
 
 		 611 aa  236  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  30.06 
 
 		 604 aa  234  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  30.16 
 
 		 611 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.71 
 
 		 600 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2524  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 423 aa  228  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00646333  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  31.14 
 
 		 613 aa  224  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  29.58 
 
 		 625 aa  224  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  30.62 
 
 		 594 aa  223  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  29.43 
 
 		 626 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  30.81 
 
 		 611 aa  221  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2522  ABC transporter, ATP-binding protein  31.81 
 
 		 608 aa  219  7.999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000536848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  30.22 
 
 		 616 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  31.49 
 
 		 625 aa  217  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  27.18 
 
 		 621 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  29.05 
 
 		 618 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  26.3 
 
 		 619 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  28.02 
 
 		 621 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  27.84 
 
 		 621 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  28.74 
 
 		 618 aa  213  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  28.74 
 
 		 618 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  31.92 
 
 		 615 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  34.29 
 
 		 615 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  32.1 
 
 		 566 aa  210  5e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.61 
 
 		 587 aa  206  7e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  27.44 
 
 		 604 aa  205  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  29.18 
 
 		 625 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  28.86 
 
 		 606 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  27.41 
 
 		 623 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  28.28 
 
 		 626 aa  199  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  26.72 
 
 		 633 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  30.33 
 
 		 599 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  28.97 
 
 		 616 aa  197  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.38 
 
 		 603 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  28.46 
 
 		 618 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  29.53 
 
 		 608 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.62 
 
 		 583 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  28.38 
 
 		 605 aa  193  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  28.26 
 
 		 603 aa  193  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  30.28 
 
 		 627 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  27.86 
 
 		 597 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.45 
 
 		 600 aa  189  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  28.86 
 
 		 626 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  28.14 
 
 		 619 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  26.62 
 
 		 618 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1188  ABC transporter related  28.85 
 
 		 579 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000012355  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  29.77 
 
 		 608 aa  188  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  27.42 
 
 		 649 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0185  ABC transporter ATP-binding protein  33.41 
 
 		 585 aa  187  6e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  27.15 
 
 		 638 aa  187  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.34 
 
 		 582 aa  186  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  25.7 
 
 		 621 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.19 
 
 		 597 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.19 
 
 		 597 aa  184  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  25.82 
 
 		 596 aa  183  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.45 
 
 		 592 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  36.56 
 
 		 611 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3192  ABC transporter related  25.83 
 
 		 701 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678636  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  27.12 
 
 		 584 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  25.12 
 
 		 605 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  27.63 
 
 		 605 aa  181  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  32.6 
 
 		 630 aa  180  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.27 
 
 		 598 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.52 
 
 		 582 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  26.38 
 
 		 595 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  39.92 
 
 		 606 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  34.02 
 
 		 599 aa  179  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  27.32 
 
 		 603 aa  177  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  35.29 
 
 		 596 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.63 
 
 		 583 aa  177  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  29.1 
 
 		 591 aa  176  9e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3873  ABC transporter related  35.38 
 
 		 623 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.13 
 
 		 602 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  31.58 
 
 		 588 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.54 
 
 		 579 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  36.92 
 
 		 622 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.69 
 
 		 589 aa  176  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  27.33 
 
 		 603 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.42 
 
 		 1019 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>