More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2389 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  65.62 
 
 		 626 aa  774    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  58.89 
 
 		 616 aa  717    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  66.78 
 
 		 618 aa  768    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  55.92 
 
 		 611 aa  688    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  66.61 
 
 		 623 aa  757    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  93.82 
 
 		 615 aa  1092    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  100 
 
 		 615 aa  1227    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  79.45 
 
 		 619 aa  985    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  68.09 
 
 		 618 aa  773    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  66.94 
 
 		 618 aa  769    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  56.03 
 
 		 638 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  43.79 
 
 		 623 aa  492  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  40.66 
 
 		 609 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  40.61 
 
 		 625 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  39.13 
 
 		 604 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  40.98 
 
 		 625 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  41.5 
 
 		 621 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  41.67 
 
 		 621 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  40.81 
 
 		 621 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  39.51 
 
 		 611 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  35.83 
 
 		 592 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.23 
 
 		 603 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  40.67 
 
 		 603 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  36.26 
 
 		 614 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.06 
 
 		 600 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  35.55 
 
 		 613 aa  362  9e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  36.01 
 
 		 613 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  40.03 
 
 		 625 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  35.09 
 
 		 618 aa  336  5.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  38.9 
 
 		 608 aa  321  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  36.33 
 
 		 608 aa  320  5e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  35.33 
 
 		 626 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  33.65 
 
 		 619 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  35.47 
 
 		 606 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  35.87 
 
 		 621 aa  302  9e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  31.03 
 
 		 605 aa  302  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  33.33 
 
 		 605 aa  302  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 616 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  32.34 
 
 		 626 aa  276  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.53 
 
 		 633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  31.5 
 
 		 611 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  39.15 
 
 		 599 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  30.99 
 
 		 566 aa  274  4.0000000000000004e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  37.09 
 
 		 662 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  26.21 
 
 		 608 aa  273  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  33.6 
 
 		 616 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  31.43 
 
 		 595 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  26.09 
 
 		 603 aa  262  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  28.73 
 
 		 597 aa  261  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  26.09 
 
 		 603 aa  261  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  30.57 
 
 		 618 aa  258  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.89 
 
 		 587 aa  258  3e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.63 
 
 		 594 aa  254  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  35.96 
 
 		 578 aa  250  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  33.01 
 
 		 633 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  34.62 
 
 		 500 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  28.27 
 
 		 606 aa  240  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  34.41 
 
 		 623 aa  238  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  34.82 
 
 		 665 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  26.94 
 
 		 596 aa  238  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  42.37 
 
 		 618 aa  237  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  32.58 
 
 		 627 aa  236  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.2 
 
 		 608 aa  235  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  35.44 
 
 		 673 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  30.23 
 
 		 596 aa  234  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  30.53 
 
 		 653 aa  234  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  28.6 
 
 		 596 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  29.77 
 
 		 624 aa  233  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.98 
 
 		 575 aa  230  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  36 
 
 		 584 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  26.17 
 
 		 604 aa  227  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  30.1 
 
 		 619 aa  227  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  28.9 
 
 		 611 aa  227  6e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  32.9 
 
 		 773 aa  226  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  30.94 
 
 		 764 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  33.67 
 
 		 631 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  29.16 
 
 		 593 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  39.4 
 
 		 607 aa  224  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  28.91 
 
 		 587 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  28.85 
 
 		 619 aa  223  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  36.08 
 
 		 625 aa  222  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  36.12 
 
 		 597 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  34.56 
 
 		 590 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.22 
 
 		 641 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  31.29 
 
 		 626 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.75 
 
 		 580 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  32.5 
 
 		 611 aa  221  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.21 
 
 		 567 aa  221  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.62 
 
 		 579 aa  220  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.96 
 
 		 639 aa  220  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  35.52 
 
 		 604 aa  219  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.67 
 
 		 614 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  32.35 
 
 		 611 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  31.67 
 
 		 617 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.27 
 
 		 586 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.79 
 
 		 577 aa  218  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  43.51 
 
 		 565 aa  218  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44 
 
 		 616 aa  217  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.31 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  30.77 
 
 		 610 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>