More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0661 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  67 
 
 		 623 aa  827    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  100 
 
 		 625 aa  1263    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  85.92 
 
 		 625 aa  1039    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  51.29 
 
 		 621 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  51.29 
 
 		 621 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  51.7 
 
 		 621 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  49.41 
 
 		 604 aa  565  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  49.83 
 
 		 609 aa  562  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  51.29 
 
 		 625 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  48.17 
 
 		 611 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.88 
 
 		 603 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  47.71 
 
 		 603 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  42.33 
 
 		 616 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  42.58 
 
 		 619 aa  474  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  40.77 
 
 		 611 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  41.52 
 
 		 615 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  40.94 
 
 		 613 aa  451  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  41.36 
 
 		 618 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 		 618 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  41.03 
 
 		 618 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  40.29 
 
 		 615 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  39.15 
 
 		 592 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  40.54 
 
 		 626 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  40.58 
 
 		 623 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  41.56 
 
 		 638 aa  422  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  40.13 
 
 		 614 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  44.86 
 
 		 613 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.88 
 
 		 600 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  37.33 
 
 		 618 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  39.37 
 
 		 605 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  37.75 
 
 		 606 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  37.16 
 
 		 608 aa  349  7e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  35.58 
 
 		 626 aa  337  5e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  33.84 
 
 		 605 aa  333  4e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  36.49 
 
 		 608 aa  326  7e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  34.65 
 
 		 626 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  36.79 
 
 		 619 aa  323  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  31.3 
 
 		 566 aa  322  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  35.25 
 
 		 616 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  34.13 
 
 		 621 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  29.27 
 
 		 608 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  32.38 
 
 		 595 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  39.17 
 
 		 599 aa  290  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.45 
 
 		 587 aa  286  7e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  34.17 
 
 		 611 aa  286  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  29.81 
 
 		 597 aa  280  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  33.72 
 
 		 633 aa  276  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  32.55 
 
 		 616 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  30.82 
 
 		 618 aa  273  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  35.2 
 
 		 627 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.85 
 
 		 633 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  27.35 
 
 		 603 aa  267  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  29.55 
 
 		 603 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  31.16 
 
 		 662 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  31.9 
 
 		 604 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  34.1 
 
 		 623 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  30.88 
 
 		 631 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.81 
 
 		 594 aa  253  6e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  34.06 
 
 		 596 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  36.62 
 
 		 578 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  33.57 
 
 		 596 aa  251  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  30 
 
 		 611 aa  249  8e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  47.13 
 
 		 604 aa  247  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  32.14 
 
 		 647 aa  246  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  36.83 
 
 		 590 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  36.4 
 
 		 500 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  29.6 
 
 		 619 aa  242  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  30.27 
 
 		 626 aa  241  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  26.45 
 
 		 591 aa  240  6.999999999999999e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  39.57 
 
 		 624 aa  239  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  28.5 
 
 		 619 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  30.43 
 
 		 653 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  35.16 
 
 		 673 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  39.24 
 
 		 606 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.12 
 
 		 597 aa  229  9e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.73 
 
 		 582 aa  229  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1839  ABC transporter related protein  37.22 
 
 		 590 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298926  normal  0.0982891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  44.73 
 
 		 634 aa  227  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.19 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  32.7 
 
 		 626 aa  226  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.46 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  31.77 
 
 		 596 aa  226  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.51 
 
 		 639 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.19 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.19 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.19 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  30.84 
 
 		 575 aa  226  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.19 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.42 
 
 		 598 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  35.92 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.92 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.92 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.92 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.92 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  35.92 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.92 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.92 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.92 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.34 
 
 		 628 aa  224  4.9999999999999996e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  29.64 
 
 		 631 aa  223  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>