More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3698 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  100 
 
 
611 aa  1248    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  63.1 
 
 
603 aa  732    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  62.4 
 
 
603 aa  728    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  59.1 
 
 
604 aa  733    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  61.27 
 
 
609 aa  761    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  47.87 
 
 
623 aa  525  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  48.17 
 
 
625 aa  519  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  45.03 
 
 
621 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  44.71 
 
 
621 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  44.87 
 
 
621 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  47.25 
 
 
625 aa  500  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  45.85 
 
 
625 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  41.43 
 
 
608 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  40.1 
 
 
616 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  38.31 
 
 
619 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  39.35 
 
 
611 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  39.31 
 
 
615 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  40.83 
 
 
623 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  38.3 
 
 
615 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  38.5 
 
 
626 aa  385  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  37.16 
 
 
618 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  36.64 
 
 
592 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  37.16 
 
 
618 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  38.03 
 
 
613 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  37.6 
 
 
618 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  36.95 
 
 
614 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  38.18 
 
 
613 aa  375  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  35.87 
 
 
638 aa  363  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.77 
 
 
600 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  34.97 
 
 
618 aa  334  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  36.9 
 
 
626 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  34.86 
 
 
605 aa  310  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  37.72 
 
 
606 aa  307  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  34.5 
 
 
608 aa  299  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  36.61 
 
 
621 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  31.05 
 
 
597 aa  289  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  34.62 
 
 
608 aa  289  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  32.64 
 
 
626 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  31.34 
 
 
605 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  33.17 
 
 
619 aa  279  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  32.79 
 
 
616 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.07 
 
 
587 aa  275  3e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  32.72 
 
 
662 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  32.7 
 
 
566 aa  263  4.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  32.63 
 
 
578 aa  260  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  32.31 
 
 
616 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.79 
 
 
633 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  31.35 
 
 
633 aa  256  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  31.29 
 
 
595 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  33.73 
 
 
627 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  36.7 
 
 
599 aa  246  6.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  28.9 
 
 
611 aa  240  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  28.72 
 
 
603 aa  236  8e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  28.14 
 
 
594 aa  236  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  28.38 
 
 
603 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  32.13 
 
 
606 aa  232  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  30.24 
 
 
618 aa  230  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  30.49 
 
 
593 aa  230  7e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  34.15 
 
 
604 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  29.8 
 
 
619 aa  226  8e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  30.13 
 
 
623 aa  226  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  33.59 
 
 
631 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  29.24 
 
 
591 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  34.87 
 
 
596 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  29.33 
 
 
619 aa  219  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  30.39 
 
 
604 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.8 
 
 
596 aa  216  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 
596 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  29.59 
 
 
673 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  29.95 
 
 
596 aa  211  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  28.98 
 
 
611 aa  210  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  31.92 
 
 
653 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  43.72 
 
 
626 aa  208  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  41.83 
 
 
500 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.91 
 
 
582 aa  206  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  28.79 
 
 
617 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  30 
 
 
611 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 
624 aa  204  4e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.66 
 
 
582 aa  204  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  26.44 
 
 
631 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  35.07 
 
 
625 aa  202  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  28.44 
 
 
588 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  30.2 
 
 
719 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  39.16 
 
 
582 aa  201  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  28.66 
 
 
647 aa  199  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.68 
 
 
575 aa  197  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  35.69 
 
 
626 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.3 
 
 
634 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.46 
 
 
582 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.46 
 
 
582 aa  196  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.46 
 
 
582 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  42.39 
 
 
582 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  42.39 
 
 
582 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  30.9 
 
 
665 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3067  ABC transporter related  31.15 
 
 
616 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000774728  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  42.39 
 
 
582 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  42.39 
 
 
582 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.14 
 
 
597 aa  195  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  42.39 
 
 
582 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  37.04 
 
 
975 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>