More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0971 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  100 
 
 		 626 aa  1259    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  52.83 
 
 		 618 aa  595  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  52.09 
 
 		 605 aa  557  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  51.01 
 
 		 606 aa  531  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.12 
 
 		 600 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  39.39 
 
 		 592 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  39.83 
 
 		 614 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  37.88 
 
 		 613 aa  395  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  37.83 
 
 		 623 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  37.99 
 
 		 604 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  37.52 
 
 		 609 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  32.24 
 
 		 605 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  38.29 
 
 		 625 aa  343  7e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  37.06 
 
 		 611 aa  340  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  36.41 
 
 		 621 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  35.91 
 
 		 621 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  35.91 
 
 		 621 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  35.19 
 
 		 619 aa  331  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  36.08 
 
 		 625 aa  330  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  34.18 
 
 		 611 aa  327  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  38.1 
 
 		 615 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  37.07 
 
 		 618 aa  326  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  37.41 
 
 		 618 aa  326  7e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  33.72 
 
 		 613 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  37.44 
 
 		 618 aa  324  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  35.32 
 
 		 603 aa  321  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  33.28 
 
 		 616 aa  320  7e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.55 
 
 		 603 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  38.24 
 
 		 625 aa  310  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  35.36 
 
 		 623 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  38.01 
 
 		 615 aa  299  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 626 aa  298  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  36.25 
 
 		 638 aa  272  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  32 
 
 		 621 aa  269  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  34.86 
 
 		 619 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  36.99 
 
 		 599 aa  260  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  27.24 
 
 		 603 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  26.96 
 
 		 603 aa  256  6e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  34.85 
 
 		 626 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  26.69 
 
 		 608 aa  256  9e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  32.95 
 
 		 608 aa  256  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  32.77 
 
 		 608 aa  254  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  34.41 
 
 		 662 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  25.04 
 
 		 597 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  28.81 
 
 		 593 aa  251  3e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.85 
 
 		 633 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  31.61 
 
 		 596 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  34.78 
 
 		 616 aa  244  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  29.51 
 
 		 611 aa  242  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  33.14 
 
 		 669 aa  240  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  27.95 
 
 		 618 aa  240  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  28.66 
 
 		 671 aa  239  9e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  31.29 
 
 		 663 aa  236  9e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  32.05 
 
 		 616 aa  234  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.05 
 
 		 613 aa  233  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  31.79 
 
 		 640 aa  229  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  30.64 
 
 		 619 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  40.23 
 
 		 597 aa  228  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2765  ABC transporter related protein  35.18 
 
 		 695 aa  226  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  24.66 
 
 		 566 aa  224  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.28 
 
 		 577 aa  224  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  44.49 
 
 		 591 aa  223  7e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  34.17 
 
 		 586 aa  223  7e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  31.32 
 
 		 595 aa  223  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  41.02 
 
 		 618 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.21 
 
 		 597 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.94 
 
 		 597 aa  221  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  28.72 
 
 		 580 aa  221  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  30.68 
 
 		 619 aa  221  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  31.1 
 
 		 616 aa  221  3.9999999999999997e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  36.55 
 
 		 672 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  30.36 
 
 		 584 aa  220  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  26.89 
 
 		 611 aa  220  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  25.86 
 
 		 624 aa  220  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  34.02 
 
 		 649 aa  220  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  33.9 
 
 		 633 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  37.43 
 
 		 672 aa  220  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  37.06 
 
 		 603 aa  220  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.21 
 
 		 582 aa  220  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  30.66 
 
 		 764 aa  220  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  30.82 
 
 		 616 aa  219  8.999999999999998e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  37.4 
 
 		 652 aa  219  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  47.06 
 
 		 603 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.53 
 
 		 582 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.3 
 
 		 582 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  31.73 
 
 		 672 aa  219  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  31.61 
 
 		 764 aa  219  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  28.85 
 
 		 608 aa  219  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  32.16 
 
 		 610 aa  219  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  31.69 
 
 		 606 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  38.35 
 
 		 589 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.16 
 
 		 609 aa  219  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  36.34 
 
 		 603 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  30.1 
 
 		 613 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.14 
 
 		 586 aa  217  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  30.4 
 
 		 627 aa  218  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1175  ABC transporter related  36.16 
 
 		 625 aa  218  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  33.19 
 
 		 607 aa  217  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  32.8 
 
 		 578 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  48.05 
 
 		 662 aa  217  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>