More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3756 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  63.2 
 
 		 633 aa  691    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  100 
 
 		 595 aa  1163    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  50.68 
 
 		 626 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  48.33 
 
 		 619 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  46.48 
 
 		 616 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  42.9 
 
 		 611 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  53.88 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  37.16 
 
 		 623 aa  325  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  36.77 
 
 		 621 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  36.61 
 
 		 621 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  36.61 
 
 		 621 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  35.33 
 
 		 604 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  31.26 
 
 		 592 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  35.99 
 
 		 625 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  33.56 
 
 		 631 aa  286  7e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  33.5 
 
 		 619 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  32.79 
 
 		 613 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  32.43 
 
 		 614 aa  280  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  33.83 
 
 		 616 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  35.83 
 
 		 625 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  32.51 
 
 		 615 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  34.85 
 
 		 625 aa  267  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  32.38 
 
 		 609 aa  267  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  30.38 
 
 		 611 aa  264  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  31.51 
 
 		 611 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  35.73 
 
 		 606 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  36.47 
 
 		 621 aa  261  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  34.11 
 
 		 603 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.45 
 
 		 603 aa  257  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  33.39 
 
 		 618 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.5 
 
 		 600 aa  254  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  33.22 
 
 		 618 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  33.17 
 
 		 626 aa  254  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  32.45 
 
 		 615 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  34.33 
 
 		 623 aa  252  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  32.25 
 
 		 608 aa  250  6e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  32.62 
 
 		 618 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  32.45 
 
 		 613 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  36.73 
 
 		 578 aa  243  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  33.75 
 
 		 618 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  33.45 
 
 		 608 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  34.39 
 
 		 638 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  36.06 
 
 		 599 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  26.33 
 
 		 566 aa  228  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  25.67 
 
 		 603 aa  227  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  26.32 
 
 		 603 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  26.78 
 
 		 594 aa  224  4.9999999999999996e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  28.57 
 
 		 605 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  28.46 
 
 		 618 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  33.27 
 
 		 616 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  31.67 
 
 		 626 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  32.6 
 
 		 605 aa  220  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.88 
 
 		 587 aa  220  6e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 623 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  31.16 
 
 		 597 aa  213  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 604 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  29.37 
 
 		 619 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  43.71 
 
 		 585 aa  207  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  33.17 
 
 		 662 aa  207  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  33.58 
 
 		 611 aa  206  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  30.16 
 
 		 619 aa  206  9e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  26.54 
 
 		 603 aa  206  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  25.04 
 
 		 596 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  25.42 
 
 		 596 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  31.39 
 
 		 720 aa  205  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.46 
 
 		 633 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  31.22 
 
 		 627 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  28.71 
 
 		 611 aa  203  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  34.57 
 
 		 647 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  33.77 
 
 		 600 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  30.73 
 
 		 571 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  29.25 
 
 		 739 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  38.41 
 
 		 579 aa  196  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  37.57 
 
 		 584 aa  196  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.57 
 
 		 567 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.24 
 
 		 605 aa  194  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  29.43 
 
 		 741 aa  194  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  32.72 
 
 		 610 aa  194  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  31.17 
 
 		 617 aa  193  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  31.25 
 
 		 705 aa  193  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.38 
 
 		 567 aa  193  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  34.11 
 
 		 590 aa  193  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  40.31 
 
 		 665 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  34.53 
 
 		 619 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  36.64 
 
 		 672 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  29.68 
 
 		 596 aa  192  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.5 
 
 		 596 aa  192  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  24.92 
 
 		 625 aa  191  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  36.19 
 
 		 720 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  24.96 
 
 		 593 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  41.53 
 
 		 578 aa  191  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  32.9 
 
 		 636 aa  191  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  34.24 
 
 		 580 aa  191  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.14 
 
 		 598 aa  190  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.88 
 
 		 971 aa  190  8e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0185  ABC transporter ATP-binding protein  25.99 
 
 		 585 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.24 
 
 		 1008 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  35.62 
 
 		 980 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  34.3 
 
 		 607 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.24 
 
 		 1008 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>