More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2586 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  100 
 
 
619 aa  1252    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  91.75 
 
 
619 aa  1130    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  30.61 
 
 
604 aa  253  8.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  28.33 
 
 
592 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  29.85 
 
 
623 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  29.19 
 
 
621 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  29.25 
 
 
621 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  29.09 
 
 
621 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.31 
 
 
600 aa  233  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  35.88 
 
 
613 aa  232  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
609 aa  231  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  30.21 
 
 
625 aa  230  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  30.64 
 
 
611 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  29.61 
 
 
662 aa  228  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  25.13 
 
 
597 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  28.03 
 
 
619 aa  224  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  30.8 
 
 
615 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  29.17 
 
 
614 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  29.16 
 
 
605 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  28.98 
 
 
625 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.53 
 
 
633 aa  217  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  28.82 
 
 
603 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  32.08 
 
 
665 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  28.69 
 
 
618 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  30.68 
 
 
626 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  27.23 
 
 
616 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  30.79 
 
 
633 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.69 
 
 
603 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  30.15 
 
 
606 aa  213  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  29.35 
 
 
611 aa  212  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  30.79 
 
 
619 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  30.46 
 
 
625 aa  208  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  28.2 
 
 
608 aa  207  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  27.39 
 
 
618 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  30.83 
 
 
616 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  32.92 
 
 
621 aa  205  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  28.2 
 
 
608 aa  204  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  27.23 
 
 
618 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  28.87 
 
 
618 aa  204  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  29.04 
 
 
615 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  33.7 
 
 
626 aa  203  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  27 
 
 
603 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  27 
 
 
603 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  28.88 
 
 
605 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  31.4 
 
 
673 aa  197  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  29.37 
 
 
653 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  29.1 
 
 
595 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  25.65 
 
 
980 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  26.87 
 
 
618 aa  191  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.71 
 
 
605 aa  190  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  25.91 
 
 
556 aa  190  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.9 
 
 
600 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  27.66 
 
 
611 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  27.86 
 
 
638 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  26.36 
 
 
604 aa  189  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  36.36 
 
 
586 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  29.65 
 
 
616 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  24.6 
 
 
594 aa  187  5e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.62 
 
 
613 aa  186  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02300  ABC-transporterMultidrug resistance protein MDR ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G1]  40 
 
 
1343 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567277  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  37.5 
 
 
627 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  28.1 
 
 
611 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  37.58 
 
 
647 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  27.24 
 
 
613 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  25.4 
 
 
591 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  26.3 
 
 
566 aa  182  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00588  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  30.02 
 
 
569 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232531  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  29.6 
 
 
626 aa  183  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.5 
 
 
606 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  36.07 
 
 
604 aa  182  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  27.08 
 
 
601 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  38.13 
 
 
601 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
613 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  31.88 
 
 
975 aa  180  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  28.85 
 
 
1042 aa  180  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.8 
 
 
583 aa  180  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  39.41 
 
 
500 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  40.56 
 
 
719 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  27.59 
 
 
603 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.55 
 
 
641 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  28.53 
 
 
623 aa  178  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  38.7 
 
 
623 aa  177  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  31.6 
 
 
578 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  26.54 
 
 
930 aa  177  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  29.95 
 
 
596 aa  176  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  26.26 
 
 
618 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.17 
 
 
639 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.36 
 
 
579 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2917  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.23 
 
 
576 aa  176  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1292  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  37.4 
 
 
590 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.96 
 
 
596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  28.6 
 
 
603 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  28.43 
 
 
768 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  26.58 
 
 
1003 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.85 
 
 
580 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  28.48 
 
 
631 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.77 
 
 
1019 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  35.41 
 
 
971 aa  173  9e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  37.3 
 
 
589 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.8 
 
 
586 aa  173  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>