More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1807 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  61.35 
 
 
633 aa  726    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  100 
 
 
662 aa  1311    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  46.41 
 
 
673 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  46.31 
 
 
631 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  44.5 
 
 
647 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  46.53 
 
 
626 aa  422  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  43.23 
 
 
665 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  42.72 
 
 
653 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  35.13 
 
 
621 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  36.97 
 
 
616 aa  323  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  33.5 
 
 
623 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  37.6 
 
 
615 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  30.22 
 
 
592 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.45 
 
 
600 aa  293  8e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  32.72 
 
 
611 aa  291  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  34.11 
 
 
609 aa  290  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  32.03 
 
 
614 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  32.44 
 
 
625 aa  285  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  31.6 
 
 
604 aa  281  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  35.43 
 
 
626 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  33.4 
 
 
625 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  35.82 
 
 
616 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  35.73 
 
 
603 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  36.77 
 
 
615 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.84 
 
 
603 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  31.82 
 
 
619 aa  264  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  35.71 
 
 
626 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  32.6 
 
 
613 aa  261  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  35.11 
 
 
618 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  36.07 
 
 
623 aa  260  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  34.86 
 
 
618 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  34.92 
 
 
618 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  32.95 
 
 
621 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  33.11 
 
 
621 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  33.84 
 
 
611 aa  253  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  32.95 
 
 
621 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  30.05 
 
 
613 aa  251  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  34.92 
 
 
619 aa  250  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  34.28 
 
 
626 aa  247  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  24.09 
 
 
608 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  28.28 
 
 
605 aa  243  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  32.13 
 
 
618 aa  241  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  28.74 
 
 
597 aa  239  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  35.16 
 
 
633 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  35.41 
 
 
638 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  32.35 
 
 
606 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  45.11 
 
 
599 aa  232  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  33.23 
 
 
611 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  33.44 
 
 
616 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  28.98 
 
 
619 aa  224  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  33.58 
 
 
608 aa  223  7e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  25.8 
 
 
566 aa  223  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  29.19 
 
 
619 aa  221  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  32.57 
 
 
605 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  26.12 
 
 
603 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  33.06 
 
 
595 aa  217  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  25.95 
 
 
603 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  43.19 
 
 
627 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  26.82 
 
 
604 aa  214  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.44 
 
 
596 aa  212  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  35.97 
 
 
608 aa  212  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  34.26 
 
 
625 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.13 
 
 
587 aa  211  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
623 aa  211  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  24.53 
 
 
591 aa  209  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  46.39 
 
 
599 aa  209  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  46.01 
 
 
681 aa  206  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.98 
 
 
641 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  25.9 
 
 
594 aa  205  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  44.24 
 
 
634 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  27.51 
 
 
611 aa  204  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.61 
 
 
639 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.86 
 
 
603 aa  200  7.999999999999999e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.08 
 
 
627 aa  200  9e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  35.04 
 
 
578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.45 
 
 
632 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  34.9 
 
 
590 aa  198  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.97 
 
 
608 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  44.94 
 
 
600 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.05 
 
 
616 aa  197  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.12 
 
 
586 aa  197  7e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.78 
 
 
618 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  44.4 
 
 
622 aa  196  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  28.2 
 
 
618 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1839  ABC transporter related protein  42.95 
 
 
590 aa  196  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298926  normal  0.0982891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.5 
 
 
618 aa  196  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  38.24 
 
 
586 aa  195  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  43.56 
 
 
500 aa  194  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  42.25 
 
 
604 aa  193  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  36.04 
 
 
618 aa  193  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  45.14 
 
 
601 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  42.32 
 
 
726 aa  191  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0852  lipid A ABC exporter family  45.11 
 
 
602 aa  191  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00564413  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.35 
 
 
629 aa  191  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.01 
 
 
605 aa  191  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  43.54 
 
 
611 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.84 
 
 
588 aa  190  7e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0382  ABC transporter related  40.98 
 
 
641 aa  190  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.588151  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  42.96 
 
 
590 aa  190  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.18 
 
 
600 aa  190  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>