More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0389 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  59.38 
 
 		 623 aa  664    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  56.08 
 
 		 618 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  56.01 
 
 		 618 aa  646    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  55.11 
 
 		 626 aa  636    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  58.79 
 
 		 615 aa  680    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  100 
 
 		 616 aa  1239    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  64.34 
 
 		 611 aa  800    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  58.27 
 
 		 615 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  61.02 
 
 		 619 aa  722    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  57 
 
 		 618 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  53.22 
 
 		 638 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  44.03 
 
 		 623 aa  496  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  43.07 
 
 		 625 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  42.33 
 
 		 625 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  43.99 
 
 		 609 aa  461  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 		 621 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  40.58 
 
 		 621 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  40.75 
 
 		 621 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  41.07 
 
 		 604 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  40.1 
 
 		 611 aa  415  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  41.88 
 
 		 603 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.81 
 
 		 603 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  40.62 
 
 		 625 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  36.35 
 
 		 592 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  36.43 
 
 		 613 aa  362  9e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  36.27 
 
 		 614 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.52 
 
 		 600 aa  348  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  36.66 
 
 		 613 aa  348  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  35.79 
 
 		 605 aa  326  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  33.72 
 
 		 618 aa  326  6e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  37.23 
 
 		 608 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  37.22 
 
 		 606 aa  306  8.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  33.28 
 
 		 626 aa  289  9e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  33.72 
 
 		 616 aa  287  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  33.5 
 
 		 608 aa  286  8e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  33.73 
 
 		 621 aa  283  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  36.32 
 
 		 599 aa  278  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  30.59 
 
 		 566 aa  276  6e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  37.1 
 
 		 578 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  34.33 
 
 		 619 aa  273  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  32.61 
 
 		 611 aa  270  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  30.73 
 
 		 605 aa  270  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  35.28 
 
 		 616 aa  270  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.47 
 
 		 633 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  32.89 
 
 		 595 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  34.69 
 
 		 626 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  29.14 
 
 		 597 aa  258  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  35.14 
 
 		 662 aa  256  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  27.24 
 
 		 603 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  27.24 
 
 		 603 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.15 
 
 		 587 aa  253  7e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  29.79 
 
 		 606 aa  250  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  32.89 
 
 		 633 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.19 
 
 		 594 aa  247  4e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  30.23 
 
 		 604 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  28.1 
 
 		 608 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  35.06 
 
 		 627 aa  237  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  34.38 
 
 		 665 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  35.38 
 
 		 631 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  28.92 
 
 		 624 aa  232  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  28.21 
 
 		 618 aa  230  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  28.91 
 
 		 611 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  29.31 
 
 		 596 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  34.82 
 
 		 500 aa  224  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  37.75 
 
 		 590 aa  223  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  28.91 
 
 		 626 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  33.94 
 
 		 626 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  32.84 
 
 		 596 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  37.99 
 
 		 625 aa  221  3.9999999999999997e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  31.95 
 
 		 673 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  30.99 
 
 		 653 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.28 
 
 		 641 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1839  ABC transporter related protein  37.99 
 
 		 590 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298926  normal  0.0982891 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  40.52 
 
 		 604 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  30.89 
 
 		 647 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.91 
 
 		 639 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  31.71 
 
 		 593 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  27.26 
 
 		 619 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  27.06 
 
 		 619 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  29.41 
 
 		 596 aa  210  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3067  ABC transporter related  27.45 
 
 		 616 aa  209  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000774728  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  40.81 
 
 		 634 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  31.82 
 
 		 594 aa  207  6e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.48 
 
 		 579 aa  206  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  29.92 
 
 		 617 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.22 
 
 		 614 aa  206  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.81 
 
 		 632 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  28.1 
 
 		 603 aa  204  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  29.69 
 
 		 611 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  32.79 
 
 		 584 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  29.48 
 
 		 586 aa  204  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  31.02 
 
 		 623 aa  203  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  35.65 
 
 		 618 aa  203  9e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.3 
 
 		 606 aa  202  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2524  ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00646333  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.6 
 
 		 619 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  38.85 
 
 		 597 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1189  ABC transporter related  26.27 
 
 		 586 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00259948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  34.51 
 
 		 575 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  29.95 
 
 		 601 aa  201  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>