More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5807 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  100 
 
 		 627 aa  1246    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  35.22 
 
 		 617 aa  313  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  35.25 
 
 		 611 aa  309  8e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  35.36 
 
 		 623 aa  272  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  35.2 
 
 		 625 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  34.17 
 
 		 623 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  33.44 
 
 		 614 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  33.73 
 
 		 611 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  38.65 
 
 		 625 aa  251  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  32.3 
 
 		 619 aa  248  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 609 aa  246  9e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  34.44 
 
 		 626 aa  241  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  30.62 
 
 		 604 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  36.39 
 
 		 611 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  34.02 
 
 		 592 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.64 
 
 		 600 aa  237  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  35.06 
 
 		 616 aa  237  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  35.39 
 
 		 626 aa  236  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  33.59 
 
 		 623 aa  233  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  35.1 
 
 		 615 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  31.93 
 
 		 613 aa  230  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  34.77 
 
 		 638 aa  230  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  32.37 
 
 		 621 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  37.96 
 
 		 618 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  37.96 
 
 		 618 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  47.13 
 
 		 618 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  36.03 
 
 		 613 aa  228  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  32.11 
 
 		 621 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  32.03 
 
 		 621 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  33.66 
 
 		 615 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  26.44 
 
 		 566 aa  223  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  33.1 
 
 		 621 aa  220  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08280  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  34.71 
 
 		 607 aa  217  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0133225  normal  0.224616 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  30.98 
 
 		 597 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  31.56 
 
 		 603 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.48 
 
 		 587 aa  214  5.999999999999999e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  38.46 
 
 		 599 aa  211  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  47.2 
 
 		 625 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.99 
 
 		 603 aa  211  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  35.64 
 
 		 616 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  32.16 
 
 		 608 aa  208  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  32.85 
 
 		 605 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  45.08 
 
 		 605 aa  207  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2522  ABC transporter, ATP-binding protein  31.06 
 
 		 608 aa  206  8e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000536848  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  27.72 
 
 		 603 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  32.1 
 
 		 618 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  27.72 
 
 		 603 aa  204  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  31.22 
 
 		 606 aa  203  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  31.16 
 
 		 619 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  43.19 
 
 		 662 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 616 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  43.73 
 
 		 653 aa  200  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.91 
 
 		 596 aa  200  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  33.21 
 
 		 578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  43.31 
 
 		 647 aa  198  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  30.68 
 
 		 588 aa  196  7e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  26.86 
 
 		 596 aa  196  9e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  31.33 
 
 		 622 aa  196  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  40 
 
 		 610 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  41.5 
 
 		 631 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  31.31 
 
 		 595 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  25 
 
 		 608 aa  193  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.46 
 
 		 633 aa  193  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  33.89 
 
 		 633 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 		 596 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  38.71 
 
 		 618 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  30.28 
 
 		 593 aa  192  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  31.73 
 
 		 631 aa  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 596 aa  191  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  37.98 
 
 		 584 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  28.16 
 
 		 603 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  41.53 
 
 		 606 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  38.49 
 
 		 624 aa  187  5e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  39.94 
 
 		 592 aa  187  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  41.43 
 
 		 626 aa  187  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  39.63 
 
 		 598 aa  186  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  37.5 
 
 		 619 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.69 
 
 		 574 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1292  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  38.73 
 
 		 590 aa  183  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  29.56 
 
 		 626 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.38 
 
 		 574 aa  183  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1189  ABC transporter related  34.46 
 
 		 586 aa  183  9.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00259948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  35.97 
 
 		 665 aa  183  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  37.01 
 
 		 625 aa  182  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.78 
 
 		 592 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3067  ABC transporter related  28.71 
 
 		 616 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000774728  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  42.63 
 
 		 598 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  33.02 
 
 		 578 aa  181  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  33.02 
 
 		 578 aa  181  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2823  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 585 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  25.15 
 
 		 591 aa  180  9e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  37.07 
 
 		 609 aa  180  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  37.15 
 
 		 619 aa  179  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.19 
 
 		 578 aa  179  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  37.07 
 
 		 609 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  37.07 
 
 		 609 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  34.05 
 
 		 596 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  26.93 
 
 		 594 aa  179  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  36.56 
 
 		 604 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  40.06 
 
 		 619 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>