More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2490 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 603 aa  1203    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  95.52 
 
 		 603 aa  1099    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  59.86 
 
 		 604 aa  734    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  63.1 
 
 		 611 aa  746    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  58.57 
 
 		 609 aa  709    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  46.95 
 
 		 623 aa  500  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 		 621 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  45.74 
 
 		 621 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  45.74 
 
 		 621 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  48.07 
 
 		 625 aa  485  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  46.8 
 
 		 625 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  46.53 
 
 		 625 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  42.59 
 
 		 608 aa  430  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  40 
 
 		 611 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  41.81 
 
 		 616 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  41.01 
 
 		 619 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  43.09 
 
 		 618 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  42.41 
 
 		 618 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  42.41 
 
 		 618 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  39.53 
 
 		 615 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  39.23 
 
 		 615 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  39.29 
 
 		 626 aa  383  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  42.46 
 
 		 638 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  41.2 
 
 		 623 aa  379  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  36.56 
 
 		 613 aa  365  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  35.27 
 
 		 592 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  36.5 
 
 		 614 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  35.41 
 
 		 613 aa  331  3e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.17 
 
 		 600 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  35.77 
 
 		 626 aa  324  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  38.24 
 
 		 606 aa  323  8e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  34.18 
 
 		 618 aa  310  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  36.45 
 
 		 608 aa  298  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  37.28 
 
 		 621 aa  297  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  34.45 
 
 		 605 aa  296  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  33.67 
 
 		 616 aa  286  9e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  34.72 
 
 		 626 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  34.48 
 
 		 619 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  34.75 
 
 		 616 aa  282  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  28.38 
 
 		 608 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  28.9 
 
 		 597 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  36.76 
 
 		 578 aa  266  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  33.33 
 
 		 605 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  28.3 
 
 		 566 aa  266  7e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 662 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 		 633 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  33.83 
 
 		 595 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.05 
 
 		 594 aa  247  4e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  37.45 
 
 		 599 aa  246  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  35.04 
 
 		 633 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.61 
 
 		 587 aa  242  1e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  31.25 
 
 		 611 aa  242  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  31.84 
 
 		 606 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  32.37 
 
 		 623 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  25.13 
 
 		 591 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  31.39 
 
 		 631 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  33.71 
 
 		 665 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  27.05 
 
 		 618 aa  226  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  31.09 
 
 		 627 aa  223  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  43.38 
 
 		 604 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.66 
 
 		 596 aa  221  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  26.04 
 
 		 603 aa  220  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  29.61 
 
 		 619 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  26.04 
 
 		 603 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  31.91 
 
 		 647 aa  217  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  33.33 
 
 		 673 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  30.4 
 
 		 596 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  32.08 
 
 		 626 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  36.7 
 
 		 500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  28.38 
 
 		 619 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  29.38 
 
 		 593 aa  209  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  31.05 
 
 		 617 aa  209  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  33.01 
 
 		 653 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  36.14 
 
 		 590 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.66 
 
 		 582 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.66 
 
 		 582 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.66 
 
 		 582 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.66 
 
 		 582 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.66 
 
 		 582 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  31.44 
 
 		 582 aa  203  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.44 
 
 		 582 aa  203  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.44 
 
 		 582 aa  203  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.44 
 
 		 582 aa  203  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.44 
 
 		 582 aa  203  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  31.44 
 
 		 582 aa  203  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.44 
 
 		 582 aa  203  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.44 
 
 		 582 aa  203  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.44 
 
 		 582 aa  203  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  30.42 
 
 		 611 aa  203  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.21 
 
 		 597 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  28.18 
 
 		 604 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 596 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.12 
 
 		 582 aa  202  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.53 
 
 		 598 aa  200  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  30.41 
 
 		 634 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.87 
 
 		 582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.28 
 
 		 582 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  28.34 
 
 		 631 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.3 
 
 		 582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  30.88 
 
 		 705 aa  198  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>