More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2538 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  69.41 
 
 		 623 aa  783    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  67.53 
 
 		 626 aa  789    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  69.93 
 
 		 618 aa  796    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  69.93 
 
 		 618 aa  795    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  81.01 
 
 		 615 aa  969    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  79.45 
 
 		 615 aa  907    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  100 
 
 		 619 aa  1232    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  58.22 
 
 		 611 aa  712    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  61.02 
 
 		 616 aa  735    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  69.77 
 
 		 618 aa  795    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  56.27 
 
 		 638 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  45.77 
 
 		 623 aa  514  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  46.17 
 
 		 625 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  40.95 
 
 		 609 aa  450  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  42.05 
 
 		 625 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  40.13 
 
 		 604 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  42.2 
 
 		 621 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  42.05 
 
 		 621 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  42.19 
 
 		 621 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  38.31 
 
 		 611 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.01 
 
 		 603 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  35.83 
 
 		 592 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  40.43 
 
 		 603 aa  399  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  35.17 
 
 		 614 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.22 
 
 		 600 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  42.14 
 
 		 625 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  36.97 
 
 		 613 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  37.05 
 
 		 618 aa  365  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  36.45 
 
 		 613 aa  362  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  37.85 
 
 		 608 aa  329  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  34.64 
 
 		 605 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  36.39 
 
 		 608 aa  324  3e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  31.93 
 
 		 605 aa  310  4e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  35.19 
 
 		 626 aa  306  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  36.33 
 
 		 606 aa  297  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  35.92 
 
 		 621 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  33.12 
 
 		 619 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  29.92 
 
 		 597 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  36.22 
 
 		 616 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  31.78 
 
 		 566 aa  282  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  28.29 
 
 		 608 aa  280  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  34.66 
 
 		 616 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  31.34 
 
 		 611 aa  277  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  38.72 
 
 		 599 aa  273  7e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  30.9 
 
 		 626 aa  273  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  32.62 
 
 		 595 aa  272  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.17 
 
 		 633 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  25.93 
 
 		 603 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  33 
 
 		 633 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  26.17 
 
 		 603 aa  264  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  31.14 
 
 		 618 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  31.66 
 
 		 662 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  30.84 
 
 		 606 aa  251  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.45 
 
 		 587 aa  250  6e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  32.46 
 
 		 627 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  26.37 
 
 		 594 aa  249  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  36.29 
 
 		 578 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  26.92 
 
 		 604 aa  243  9e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  35.41 
 
 		 500 aa  241  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  31.86 
 
 		 653 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  30.45 
 
 		 624 aa  239  9e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  33.79 
 
 		 665 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  33.7 
 
 		 626 aa  239  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  33.74 
 
 		 623 aa  236  9e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  27.55 
 
 		 596 aa  233  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  29.62 
 
 		 596 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  28.66 
 
 		 619 aa  231  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  29.85 
 
 		 596 aa  230  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  35.25 
 
 		 673 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  28.04 
 
 		 611 aa  229  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.57 
 
 		 608 aa  229  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  31.72 
 
 		 611 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  28.22 
 
 		 619 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.83 
 
 		 580 aa  226  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.2 
 
 		 596 aa  223  9e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  33.59 
 
 		 631 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  26.19 
 
 		 593 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  34.38 
 
 		 647 aa  220  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  31.01 
 
 		 617 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  30.4 
 
 		 575 aa  219  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  37.76 
 
 		 625 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.14 
 
 		 584 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  41.64 
 
 		 604 aa  216  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.21 
 
 		 641 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.62 
 
 		 586 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  31.76 
 
 		 626 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  28.33 
 
 		 626 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.91 
 
 		 634 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.75 
 
 		 616 aa  214  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.82 
 
 		 639 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  32.48 
 
 		 611 aa  213  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.1 
 
 		 606 aa  213  7.999999999999999e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  32.88 
 
 		 586 aa  213  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.57 
 
 		 614 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.65 
 
 		 619 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  45.53 
 
 		 746 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.14 
 
 		 618 aa  212  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.29 
 
 		 632 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3344  ABC transporter related  33.05 
 
 		 615 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  29.8 
 
 		 597 aa  211  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>