More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1839 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  91.02 
 
 		 590 aa  1027    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1839  ABC transporter related protein  100 
 
 		 590 aa  1134    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298926  normal  0.0982891 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.03 
 
 		 596 aa  290  7e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  36.59 
 
 		 578 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 604 aa  261  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  35.24 
 
 		 614 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.13 
 
 		 600 aa  247  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  35.92 
 
 		 625 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  36.67 
 
 		 623 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  37.05 
 
 		 616 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  37.97 
 
 		 625 aa  233  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  33.54 
 
 		 609 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  36.52 
 
 		 618 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  37.59 
 
 		 615 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  36.52 
 
 		 618 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  37.62 
 
 		 618 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  35.47 
 
 		 621 aa  223  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  36.14 
 
 		 619 aa  219  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  31.72 
 
 		 592 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  33.54 
 
 		 604 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  32.64 
 
 		 611 aa  212  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  37.44 
 
 		 615 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  36.12 
 
 		 603 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  33.79 
 
 		 611 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  37.31 
 
 		 626 aa  209  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  34.52 
 
 		 613 aa  208  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  37.38 
 
 		 638 aa  206  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  28.91 
 
 		 613 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  33.66 
 
 		 617 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.13 
 
 		 633 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.48 
 
 		 603 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  35.51 
 
 		 623 aa  204  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  37.29 
 
 		 626 aa  204  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  33.78 
 
 		 616 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  35.39 
 
 		 618 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  35.51 
 
 		 621 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  29.28 
 
 		 611 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  35.29 
 
 		 621 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  35.29 
 
 		 621 aa  200  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  44.57 
 
 		 608 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  26.83 
 
 		 597 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  38.59 
 
 		 623 aa  196  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  24.02 
 
 		 608 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  28.8 
 
 		 605 aa  194  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  38.01 
 
 		 673 aa  194  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  45.26 
 
 		 662 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  35.28 
 
 		 626 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  36.12 
 
 		 633 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  34.03 
 
 		 595 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  40.85 
 
 		 599 aa  187  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  43.38 
 
 		 619 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  30.67 
 
 		 627 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  26.44 
 
 		 606 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  39.58 
 
 		 605 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  34.47 
 
 		 606 aa  183  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  26.58 
 
 		 566 aa  182  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  36.76 
 
 		 616 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  35.97 
 
 		 611 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  32.68 
 
 		 608 aa  181  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  26.91 
 
 		 603 aa  181  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  26.77 
 
 		 603 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  25.49 
 
 		 594 aa  179  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  36.25 
 
 		 625 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  40.58 
 
 		 631 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  25.42 
 
 		 594 aa  178  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  42.53 
 
 		 586 aa  177  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  34.29 
 
 		 631 aa  177  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  41.64 
 
 		 626 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.15 
 
 		 586 aa  174  5e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  33.92 
 
 		 618 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  36.73 
 
 		 647 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  37.5 
 
 		 976 aa  170  5e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.94 
 
 		 587 aa  170  7e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  38.04 
 
 		 589 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  35.02 
 
 		 653 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  25.59 
 
 		 591 aa  169  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  43.31 
 
 		 500 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  26.11 
 
 		 596 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  36.42 
 
 		 975 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  26.96 
 
 		 625 aa  168  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  27.81 
 
 		 610 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.44 
 
 		 603 aa  167  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  32.83 
 
 		 602 aa  167  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  37.07 
 
 		 971 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.13 
 
 		 579 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  35.09 
 
 		 665 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.47 
 
 		 1003 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  41.06 
 
 		 590 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  31.31 
 
 		 596 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2823  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 585 aa  164  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  33.54 
 
 		 724 aa  163  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  25.87 
 
 		 596 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  33.54 
 
 		 724 aa  163  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  35.38 
 
 		 584 aa  163  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 720 aa  163  9e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  25.91 
 
 		 611 aa  163  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.23 
 
 		 619 aa  163  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  27.54 
 
 		 622 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.62 
 
 		 583 aa  163  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  30.86 
 
 		 652 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>