More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3877 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  100 
 
 		 673 aa  1332    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.15 
 
 		 633 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  46.41 
 
 		 662 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  38.74 
 
 		 653 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  40.17 
 
 		 647 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  37.5 
 
 		 631 aa  352  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  37.44 
 
 		 626 aa  335  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  36.19 
 
 		 665 aa  333  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  33.33 
 
 		 621 aa  294  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  32.61 
 
 		 609 aa  278  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  33.6 
 
 		 616 aa  265  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  30.82 
 
 		 623 aa  263  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  31.29 
 
 		 604 aa  253  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.52 
 
 		 600 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  31.97 
 
 		 625 aa  248  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  32.13 
 
 		 621 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  32.13 
 
 		 621 aa  243  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  31.76 
 
 		 614 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  32.47 
 
 		 616 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  34.78 
 
 		 615 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  29.78 
 
 		 592 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  31.97 
 
 		 621 aa  240  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  32.41 
 
 		 618 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  30.1 
 
 		 625 aa  238  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  33.9 
 
 		 619 aa  237  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  35.4 
 
 		 626 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  29.87 
 
 		 611 aa  237  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  32.53 
 
 		 611 aa  233  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  34.61 
 
 		 615 aa  231  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  32.4 
 
 		 618 aa  230  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  32.4 
 
 		 618 aa  229  8e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  31.33 
 
 		 626 aa  229  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  31.06 
 
 		 603 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  28.41 
 
 		 613 aa  226  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  32.82 
 
 		 613 aa  223  9e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  34.42 
 
 		 638 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.3 
 
 		 603 aa  220  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  32.06 
 
 		 625 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  30.52 
 
 		 619 aa  218  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  32.51 
 
 		 619 aa  214  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  29.69 
 
 		 605 aa  214  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  23.81 
 
 		 608 aa  213  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  29.85 
 
 		 619 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  31.16 
 
 		 626 aa  211  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  32.44 
 
 		 608 aa  208  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  31.88 
 
 		 623 aa  206  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  36.45 
 
 		 611 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  32.21 
 
 		 616 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  30.58 
 
 		 618 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  30.21 
 
 		 611 aa  198  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  26.94 
 
 		 597 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  32.03 
 
 		 595 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  31.7 
 
 		 578 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  45.79 
 
 		 590 aa  193  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  30.66 
 
 		 617 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  31.19 
 
 		 608 aa  191  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  23.59 
 
 		 603 aa  189  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  24.31 
 
 		 603 aa  189  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  41.92 
 
 		 634 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  30.86 
 
 		 633 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  25.22 
 
 		 594 aa  187  7e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.31 
 
 		 641 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  29.81 
 
 		 606 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.02 
 
 		 632 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  25 
 
 		 591 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  31.89 
 
 		 623 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  38.95 
 
 		 500 aa  183  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.86 
 
 		 627 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1839  ABC transporter related protein  37.69 
 
 		 590 aa  183  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298926  normal  0.0982891 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.44 
 
 		 639 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  38.83 
 
 		 586 aa  182  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  24.77 
 
 		 566 aa  181  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  40 
 
 		 596 aa  181  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  39.34 
 
 		 712 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.04 
 
 		 586 aa  181  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  36.88 
 
 		 599 aa  181  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 		 603 aa  180  7e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.86 
 
 		 629 aa  180  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  40.93 
 
 		 586 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  40.16 
 
 		 746 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  40.96 
 
 		 611 aa  178  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  31.22 
 
 		 602 aa  177  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  41.92 
 
 		 619 aa  177  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.8 
 
 		 587 aa  177  8e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.09 
 
 		 583 aa  176  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  40 
 
 		 627 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.75 
 
 		 596 aa  176  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.74 
 
 		 613 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  29.9 
 
 		 631 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  25.55 
 
 		 596 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0735  lipid transporter ATP-binding/permease protein  39.75 
 
 		 582 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  26.35 
 
 		 596 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2049  ABC transporter, transmembrane region  45.49 
 
 		 616 aa  174  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  40.91 
 
 		 728 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  23.4 
 
 		 604 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  37.36 
 
 		 586 aa  173  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.06 
 
 		 579 aa  172  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.29 
 
 		 583 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  39.62 
 
 		 726 aa  172  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.43 
 
 		 736 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>