More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0029 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0029  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 592 aa  1210    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0444277  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2522  ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 		 608 aa  401  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000536848  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  38.29 
 
 		 594 aa  353  4e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  31.3 
 
 		 618 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  31.8 
 
 		 603 aa  323  6e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  31.8 
 
 		 603 aa  323  7e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  31.37 
 
 		 610 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  30.36 
 
 		 622 aa  257  4e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  28.52 
 
 		 594 aa  256  9e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  29.83 
 
 		 624 aa  249  8e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3067  ABC transporter related  28.83 
 
 		 616 aa  249  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000774728  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  29.53 
 
 		 596 aa  247  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  31.96 
 
 		 606 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  29.9 
 
 		 593 aa  242  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  31.61 
 
 		 623 aa  241  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  30.07 
 
 		 596 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 		 625 aa  238  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  29.67 
 
 		 626 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1188  ABC transporter related  39.82 
 
 		 579 aa  227  6e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000012355  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  31.58 
 
 		 588 aa  226  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  29.29 
 
 		 611 aa  224  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2524  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 423 aa  223  8e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00646333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  34.94 
 
 		 604 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  28.84 
 
 		 611 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  30.7 
 
 		 613 aa  214  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  28.46 
 
 		 615 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  28.06 
 
 		 626 aa  209  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  28.35 
 
 		 614 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  29.04 
 
 		 625 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  27.09 
 
 		 619 aa  204  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  26.47 
 
 		 616 aa  203  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  26.61 
 
 		 618 aa  203  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  29.07 
 
 		 625 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  27.47 
 
 		 618 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  27.67 
 
 		 618 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  30.9 
 
 		 623 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  27.91 
 
 		 604 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  29.15 
 
 		 603 aa  197  5.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  31.29 
 
 		 592 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  28.26 
 
 		 621 aa  194  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  28.74 
 
 		 597 aa  193  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  33.16 
 
 		 611 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  24.63 
 
 		 621 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  27.73 
 
 		 609 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  27.76 
 
 		 615 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  25.49 
 
 		 618 aa  190  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  23.72 
 
 		 621 aa  190  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1189  ABC transporter related  27.53 
 
 		 586 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00259948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  23.72 
 
 		 621 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  28.21 
 
 		 638 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.54 
 
 		 587 aa  184  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  28.24 
 
 		 647 aa  183  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  33.44 
 
 		 619 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.97 
 
 		 600 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  29.97 
 
 		 613 aa  182  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  38.87 
 
 		 575 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  27.97 
 
 		 603 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.48 
 
 		 603 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1787  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  34.15 
 
 		 582 aa  178  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134057  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.41 
 
 		 578 aa  177  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  27.97 
 
 		 626 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  25.59 
 
 		 611 aa  177  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  29.01 
 
 		 599 aa  177  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  31.25 
 
 		 653 aa  177  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  38.52 
 
 		 609 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  29.82 
 
 		 1194 aa  176  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  38.43 
 
 		 621 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  39.09 
 
 		 609 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  39.09 
 
 		 609 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.82 
 
 		 619 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  33.23 
 
 		 584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  36.01 
 
 		 578 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.01 
 
 		 578 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.43 
 
 		 634 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  39.75 
 
 		 577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1642  ABC transporter, transmembrane region, type 1  34.96 
 
 		 573 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0717  ATPase  29.97 
 
 		 583 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000641338  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.74 
 
 		 577 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  29.24 
 
 		 662 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  34.08 
 
 		 730 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  33.95 
 
 		 578 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  33.95 
 
 		 578 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  38.68 
 
 		 609 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.52 
 
 		 566 aa  174  5e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  30.77 
 
 		 610 aa  174  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  30.28 
 
 		 608 aa  174  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.77 
 
 		 609 aa  174  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  30.97 
 
 		 609 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1493  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.88 
 
 		 621 aa  173  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  29.73 
 
 		 593 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  36.59 
 
 		 606 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1427  ABC transporter-like  34.14 
 
 		 610 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.582294  normal  0.104251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.06 
 
 		 633 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  31.69 
 
 		 613 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  37.6 
 
 		 580 aa  171  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  30.67 
 
 		 582 aa  171  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  32.21 
 
 		 617 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  37.75 
 
 		 588 aa  170  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  28.29 
 
 		 627 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  33.42 
 
 		 609 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.394506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>