68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0824 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  393  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  37.76 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  35.79 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  36.93 
 
 		 182 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  32.46 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  32.11 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  31.35 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  33.12 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  34 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  34 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  32.79 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  33.69 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  33 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  30.16 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  32.94 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  29.94 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  31.11 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  34.78 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  31.58 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  32.35 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  29.8 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  31.31 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  32.98 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  30 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  28.16 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  30.16 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  29.85 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  32.82 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  29.5 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  32.76 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  31.36 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  30.37 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  28.87 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  30.93 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  27.89 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  30.93 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  29.29 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  30.93 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  27.51 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  27.53 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  29.38 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  28.79 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  28.18 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  27.27 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  29.19 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  30.39 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  31.03 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  25.16 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  30.97 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  27.23 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  28.9 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  29.63 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  30.06 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  26.02 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  29.08 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2290  hypothetical protein  28.8 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  24.85 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 437 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  33.7 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  28.76 
 
 		 284 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  27.51 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  23.45 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3649  hypothetical protein  39.02 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0565628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  31.65 
 
 		 248 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  27.81 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  21.74 
 
 		 259 aa  41.2  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  29.56 
 
 		 267 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>