42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3298 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  34.6 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  36.73 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3649  hypothetical protein  47.89 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0565628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  28.27 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  31.98 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  33.52 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  30.3 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  30.69 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  30.69 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  30.69 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  29.23 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  29.44 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  28.88 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  30.98 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  29.67 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  31.68 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  44.93 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  30.93 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  27.84 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  31.36 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  31.15 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  32.63 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  27.18 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  31.87 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  29.95 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  31.32 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  30.06 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  30.85 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  31.44 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  30.23 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  39.36 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  39.13 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  34.24 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  27.27 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  30.25 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  30.26 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  28.22 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  29.3 
 
 		 183 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  32.34 
 
 		 194 aa  42  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>