16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3649 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3649  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0565628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  64.56 
 
 
220 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  46.38 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  28.63 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  37.21 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  37.21 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  37.21 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  27.48 
 
 
189 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  29.36 
 
 
199 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  25.33 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  24.89 
 
 
189 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  29.55 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  32.63 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  25.88 
 
 
185 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  35.63 
 
 
191 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  37.18 
 
 
193 aa  42.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>