51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11744 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  376  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  32.87 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  29.79 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  31.05 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  29.07 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  31.01 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  31.25 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  31.28 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  29.61 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  29.61 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  29.61 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  28.19 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  32.62 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  30.22 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  32.93 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  28.02 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  28.06 
 
 
194 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  27.91 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  28.72 
 
 
191 aa  58.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  30.94 
 
 
180 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  27.55 
 
 
189 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  29.82 
 
 
177 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  26.2 
 
 
183 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  26.19 
 
 
202 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  29.79 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  28.57 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  33.1 
 
 
230 aa  54.7  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  30.77 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  31.63 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  30.94 
 
 
194 aa  51.6  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  26.29 
 
 
184 aa  51.2  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  23.43 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  25.64 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  26.15 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  32.16 
 
 
200 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  28.49 
 
 
186 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3649  hypothetical protein  25.89 
 
 
238 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0565628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  27.17 
 
 
187 aa  47.8  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  26.23 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  28.65 
 
 
167 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
437 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  25.5 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  30.1 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  26.73 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  31.78 
 
 
197 aa  45.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  34.75 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  26.09 
 
 
202 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  27.71 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  32.4 
 
 
190 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  24.29 
 
 
188 aa  41.6  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  25.41 
 
 
187 aa  41.2  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>