41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8890 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  63.92 
 
 		 198 aa  223  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  30.6 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  30.39 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  34.29 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  28.19 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  33.54 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1000  hypothetical protein  30.43 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  33.56 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  33.56 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  33.56 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  31.36 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  31.14 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  28.88 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  29.19 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  28.11 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  28.42 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  30.68 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  29.01 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  30.69 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  26.83 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  26.37 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  26.86 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3649  hypothetical protein  38.6 
 
 		 238 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0565628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  26.88 
 
 		 177 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  28.73 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  26.86 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  27.98 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  25.71 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 437 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  30.08 
 
 		 184 aa  45.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  30 
 
 		 193 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  34.67 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  32.81 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  28.89 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  28.66 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  31.08 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  26.72 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  25.68 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3207  protein of unknown function DUF1503  32.39 
 
 		 257 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.0564696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  27.27 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>